Mercurial > repos > iuc > bcftools_convert_to_vcf
directory /test-data/ @ 11:8bb5efd7a3dd draft
| name | size | permissions |
|---|---|---|
| [up] | drwxr-xr-x | |
 test-cache/
|
drwxr-xr-x | |
 23andme.fa
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287 | -rw-r--r-- |
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annotate.hdr
|
259 | -rw-r--r-- |
|
annotate.tab
|
700 | -rw-r--r-- |
|
annotate.vcf
|
2649 | -rw-r--r-- |
|
annotate2.tab
|
82 | -rw-r--r-- |
|
annotate2.vcf
|
1115 | -rw-r--r-- |
|
annotate3.vcf
|
1181 | -rw-r--r-- |
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annotate4.vcf
|
630 | -rw-r--r-- |
|
annots.bcf
|
1254 | -rw-r--r-- |
|
annots.vcf
|
2646 | -rw-r--r-- |
|
annots2.vcf
|
1154 | -rw-r--r-- |
|
annots4.tab
|
156 | -rw-r--r-- |
|
annots4.vcf
|
752 | -rw-r--r-- |
|
check.vcf
|
2692 | -rw-r--r-- |
|
cnv.vcf
|
16703 | -rw-r--r-- |
|
cnv_baf_only.vcf
|
9148 | -rw-r--r-- |
|
cnv_pairwise_summary.tab
|
198 | -rw-r--r-- |
|
cnv_summary.tab
|
182 | -rw-r--r-- |
|
color_chrs.dat
|
210 | -rw-r--r-- |
|
color_chrs_unrelated.dat
|
213 | -rw-r--r-- |
|
concat.1.a.vcf
|
1774 | -rw-r--r-- |
|
concat.1.b.vcf
|
1136 | -rw-r--r-- |
|
concat.2.a.vcf
|
743 | -rw-r--r-- |
|
concat.2.b.vcf
|
1194 | -rw-r--r-- |
|
concat.3.0.vcf
|
410 | -rw-r--r-- |
|
concat.3.a.vcf
|
1414 | -rw-r--r-- |
|
concat.3.b.vcf
|
15636 | -rw-r--r-- |
|
concat.3.c.vcf
|
942 | -rw-r--r-- |
|
concat.3.d.vcf
|
866 | -rw-r--r-- |
|
concat.3.e.vcf
|
866 | -rw-r--r-- |
|
concat.3.f.vcf
|
866 | -rw-r--r-- |
|
consensus.1.chain
|
132 | -rw-r--r-- |
|
consensus.1.out
|
1026 | -rw-r--r-- |
|
consensus.fa
|
1031 | -rw-r--r-- |
|
consensus.tab
|
31 | -rw-r--r-- |
|
consensus.vcf
|
660 | -rw-r--r-- |
|
convert.23andme
|
440 | -rw-r--r-- |
|
convert.gs.gt.gen
|
3236 | -rw-r--r-- |
|
convert.gs.gt.samples
|
204 | -rw-r--r-- |
|
convert.gvcf.vcf
|
9300 | -rw-r--r-- |
|
convert.hls.gt.hap
|
1402 | -rw-r--r-- |
|
convert.hls.gt.legend
|
986 | -rw-r--r-- |
|
convert.hls.gt.samples
|
288 | -rw-r--r-- |
|
convert.hs.gt.hap
|
2893 | -rw-r--r-- |
|
convert.hs.gt.samples
|
204 | -rw-r--r-- |
|
convert.vcf
|
7966 | -rw-r--r-- |
|
csq.fa
|
1840 | -rw-r--r-- |
|
csq.gff3
|
2529 | -rw-r--r-- |
|
csq.vcf
|
3316 | -rw-r--r-- |
|
fasta_indexes.loc
|
324 | -rw-r--r-- |
|
filter.1.vcf
|
2308 | -rw-r--r-- |
|
filter.2.vcf
|
2472 | -rw-r--r-- |
|
filter.3.vcf
|
3676 | -rw-r--r-- |
|
filter.4.vcf
|
564 | -rw-r--r-- |
|
fixploidy.ploidy
|
198 | -rw-r--r-- |
|
fixploidy.samples
|
12 | -rw-r--r-- |
|
fixploidy.vcf
|
1131 | -rw-r--r-- |
|
gvcf.fa
|
472 | -rw-r--r-- |
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isec.a.vcf
|
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isec.b.vcf
|
1797 | -rw-r--r-- |
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merge.2.a.vcf
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merge.2.b.vcf
|
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merge.3.b.vcf
|
1672 | -rw-r--r-- |
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merge.4.a.vcf
|
2269 | -rw-r--r-- |
|
merge.4.b.vcf
|
2228 | -rw-r--r-- |
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merge.a.vcf
|
2491 | -rw-r--r-- |
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merge.b.vcf
|
3272 | -rw-r--r-- |
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merge.c.vcf
|
3212 | -rw-r--r-- |
|
mpileup.1.bam
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mpileup.2.bam
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mpileup.2.bam.bai
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96 | -rw-r--r-- |
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mpileup.3.bam
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27569 | -rw-r--r-- |
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mpileup.3.bam.bai
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96 | -rw-r--r-- |
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mpileup.3.cram
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mpileup.4.bam
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26690 | -rw-r--r-- |
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mpileup.X.vcf
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mpileup.c.X.vcf
|
643355 | -rw-r--r-- |
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mpileup.c.vcf
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mpileup.ploidy
|
49 | -rw-r--r-- |
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mpileup.ref.fa
|
4284 | -rw-r--r-- |
|
mpileup.regions.bed
|
10 | -rw-r--r-- |
|
mpileup.regions.tab
|
11 | -rw-r--r-- |
|
mpileup.samples
|
30 | -rw-r--r-- |
|
mpileup.tab
|
127 | -rw-r--r-- |
|
mpileup.vcf
|
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|
norm.fa
|
1167 | -rw-r--r-- |
|
norm.merge.vcf
|
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norm.setref.vcf
|
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|
norm.split.vcf
|
4803 | -rw-r--r-- |
|
norm.vcf
|
5015 | -rw-r--r-- |
|
plugin1.vcf
|
2269 | -rw-r--r-- |
|
plugin_frameshifts.bed
|
18 | -rw-r--r-- |
|
query.filter.vcf
|
1189 | -rw-r--r-- |
|
query.out
|
536 | -rw-r--r-- |
|
query.vcf
|
2312 | -rw-r--r-- |
|
reheader.hdr
|
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|
reheader.samples
|
8 | -rw-r--r-- |
|
reheader.samples2
|
24 | -rw-r--r-- |
|
reheader.vcf
|
3917 | -rw-r--r-- |
|
roh.vcf
|
298067 | -rw-r--r-- |
|
stats.a.vcf
|
379 | -rw-r--r-- |
|
stats.b.vcf
|
379 | -rw-r--r-- |
|
summary.pdf
|
38887 | -rw-r--r-- |
|
vcf2sex.vcf
|
859 | -rw-r--r-- |
|
view.GL.vcf
|
1959 | -rw-r--r-- |
|
view.bcf
|
2384 | -rw-r--r-- |
|
view.filter.vcf
|
3678 | -rw-r--r-- |
|
view.vcf
|
5506 | -rw-r--r-- |
|
view.vcf_bgzip
|
2071 | -rw-r--r-- |