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--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/test-db/busco_downloads/information/lineages_list.2021-12-14.txt Fri Apr 14 08:13:46 2023 +0000 @@ -0,0 +1,199 @@ + +################################################ + +Datasets available to be used with BUSCO v4 and v5: + + bacteria_odb10 + - acidobacteria_odb10 + - actinobacteria_phylum_odb10 + - actinobacteria_class_odb10 + - corynebacteriales_odb10 + - micrococcales_odb10 + - propionibacteriales_odb10 + - streptomycetales_odb10 + - streptosporangiales_odb10 + - coriobacteriia_odb10 + - coriobacteriales_odb10 + - aquificae_odb10 + - bacteroidetes-chlorobi_group_odb10 + - bacteroidetes_odb10 + - bacteroidia_odb10 + - bacteroidales_odb10 + - cytophagia_odb10 + - cytophagales_odb10 + - flavobacteriia_odb10 + - flavobacteriales_odb10 + - sphingobacteriia_odb10 + - chlorobi_odb10 + - chlamydiae_odb10 + - chloroflexi_odb10 + - cyanobacteria_odb10 + - chroococcales_odb10 + - nostocales_odb10 + - oscillatoriales_odb10 + - synechococcales_odb10 + - firmicutes_odb10 + - bacilli_odb10 + - bacillales_odb10 + - lactobacillales_odb10 + - clostridia_odb10 + - clostridiales_odb10 + - thermoanaerobacterales_odb10 + - selenomonadales_odb10 + - tissierellia_odb10 + - tissierellales_odb10 + - fusobacteria_odb10 + - fusobacteriales_odb10 + - planctomycetes_odb10 + - proteobacteria_odb10 + - alphaproteobacteria_odb10 + - rhizobiales_odb10 + - rhizobium-agrobacterium_group_odb10 + - rhodobacterales_odb10 + - rhodospirillales_odb10 + - rickettsiales_odb10 + - sphingomonadales_odb10 + - betaproteobacteria_odb10 + - burkholderiales_odb10 + - neisseriales_odb10 + - nitrosomonadales_odb10 + - delta-epsilon-subdivisions_odb10 + - deltaproteobacteria_odb10 + - desulfobacterales_odb10 + - desulfovibrionales_odb10 + - desulfuromonadales_odb10 + - epsilonproteobacteria_odb10 + - campylobacterales_odb10 + - gammaproteobacteria_odb10 + - alteromonadales_odb10 + - cellvibrionales_odb10 + - chromatiales_odb10 + - enterobacterales_odb10 + - legionellales_odb10 + - oceanospirillales_odb10 + - pasteurellales_odb10 + - pseudomonadales_odb10 + - thiotrichales_odb10 + - vibrionales_odb10 + - xanthomonadales_odb10 + - spirochaetes_odb10 + - spirochaetia_odb10 + - spirochaetales_odb10 + - synergistetes_odb10 + - tenericutes_odb10 + - mollicutes_odb10 + - entomoplasmatales_odb10 + - mycoplasmatales_odb10 + - thermotogae_odb10 + - verrucomicrobia_odb10 + archaea_odb10 + - thaumarchaeota_odb10 + - thermoprotei_odb10 + - thermoproteales_odb10 + - sulfolobales_odb10 + - desulfurococcales_odb10 + - euryarchaeota_odb10 + - thermoplasmata_odb10 + - methanococcales_odb10 + - methanobacteria_odb10 + - methanomicrobia_odb10 + - methanomicrobiales_odb10 + - halobacteria_odb10 + - halobacteriales_odb10 + - natrialbales_odb10 + - haloferacales_odb10 + eukaryota_odb10 + - alveolata_odb10 + - apicomplexa_odb10 + - aconoidasida_odb10 + - plasmodium_odb10 + - coccidia_odb10 + - euglenozoa_odb10 + - fungi_odb10 + - ascomycota_odb10 + - dothideomycetes_odb10 + - capnodiales_odb10 + - pleosporales_odb10 + - eurotiomycetes_odb10 + - chaetothyriales_odb10 + - eurotiales_odb10 + - onygenales_odb10 + - leotiomycetes_odb10 + - helotiales_odb10 + - saccharomycetes_odb10 + - sordariomycetes_odb10 + - glomerellales_odb10 + - hypocreales_odb10 + - basidiomycota_odb10 + - agaricomycetes_odb10 + - agaricales_odb10 + - boletales_odb10 + - polyporales_odb10 + - tremellomycetes_odb10 + - microsporidia_odb10 + - mucoromycota_odb10 + - mucorales_odb10 + - metazoa_odb10 + - arthropoda_odb10 + - arachnida_odb10 + - insecta_odb10 + - endopterygota_odb10 + - diptera_odb10 + - hymenoptera_odb10 + - lepidoptera_odb10 + - hemiptera_odb10 + - mollusca_odb10 + - nematoda_odb10 + - vertebrata_odb10 + - actinopterygii_odb10 + - cyprinodontiformes_odb10 + - tetrapoda_odb10 + - mammalia_odb10 + - eutheria_odb10 + - euarchontoglires_odb10 + - glires_odb10 + - primates_odb10 + - laurasiatheria_odb10 + - carnivora_odb10 + - cetartiodactyla_odb10 + - sauropsida_odb10 + - aves_odb10 + - passeriformes_odb10 + - stramenopiles_odb10 + - viridiplantae_odb10 + - chlorophyta_odb10 + - embryophyta_odb10 + - liliopsida_odb10 + - poales_odb10 + - eudicots_odb10 + - brassicales_odb10 + - fabales_odb10 + - solanales_odb10 + viruses (no root dataset) + - alphaherpesvirinae_odb10 + - baculoviridae_odb10 + - rudiviridae_odb10 + - betaherpesvirinae_odb10 + - herpesviridae_odb10 + - poxviridae_odb10 + - tevenvirinae_odb10 + - aviadenovirus_odb10 + - enquatrovirus_odb10 + - teseptimavirus_odb10 + - bclasvirinae_odb10 + - fromanvirus_odb10 + - skunavirus_odb10 + - betabaculovirus_odb10 + - pahexavirus_odb10 + - alphabaculovirus_odb10 + - tunavirinae_odb10 + - simplexvirus_odb10 + - gammaherpesvirinae_odb10 + - varicellovirus_odb10 + - cheoctovirus_odb10 + - guernseyvirinae_odb10 + - tequatrovirus_odb10 + - chordopoxvirinae_odb10 + - peduovirus_odb10 + - iridoviridae_odb10 + - spounavirinae_odb10