Mercurial > repos > iuc > kc_align
comparison test-data/kc-align.fasta @ 0:04b13fc809ac draft
"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/kc-align commit 3b23039a67d8cb2d185c56df50b837e5601a95bf"
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1 >MN908947.3 Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome | |
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67 > AY304486.1 SARS coronavirus SZ3, complete genome | |
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132 CATTACACATAA | |
133 > AY394996.1 SARS coronavirus ZS-B, complete genome | |
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193 GGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAAAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCT | |
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198 CATTACACATAA | |
199 > MG772934.1 Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZXC21, complete genome | |
200 ATG---TTGTTTTTCTTGTTTCTTCAGTTCGCCTTAGTAAACTCCCAGTGT---GATTTG | |
201 ACAGGTAGAACTCCACTCAAT------------CCCAATTATACTAAT------TCTTCA | |
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209 AAATCCTTTATGTTGAACATTTCTGGTAATGGTGGTCTGTTCAACACTCTCAGAGAGTTT | |
210 GTTTTTAGAAATGTCGATGGGCATTTCAAGATTTACTCAAAATTTACACCAGTAAACTTA | |
211 AATCGTGGCTTACCTACTGGTCTTTCAGTACTTCAACCGTTGGTTGAATTACCAGTTAGC | |
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213 GACCCTATGTCTAATAATGGCTGGACTGCTTTTTCAGCTGCTTATTTCGTGGGCTATCTT | |
214 AAACCACGTACCTTTATGCTGAAATATAATGAGAATGGCACCATTACTGATGCTGTTGAT | |
215 TGTGCACTTGACCCTCTTTCGGAGACAAAGTGTACGTTAAAATCTCTTAGTGTTCAAAAG | |
216 GGTATCTATCAGACTTCTAACTTTCGAGTGCAACCCACTCAGTCTATAGTTAGATTTCCT | |
217 AATATTACCAATGTGTGTCCATTTCACAAGGTTTTTAATGCCACAAGGTTTCCTTCTGTT | |
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219 TCAACTTCTTTTTCTACTTTCAAATGTTATGGTGTTTCACCCTCTAAATTGATTGATTTG | |
220 TGTTTTACGAGTGTGTATGCTGATACATTTCTCATAAGATTTTCAGAGGTCAGACAAGTG | |
221 GCACCAGGACAGACTGGTGTTATTGCTGACTACAATTATAAATTACCTGATGATTTTACA | |
222 GGTTGTGTCATAGCCTGGAACACAGCAAAACAGGACACAGGT---------------CAT | |
223 TATTTCTATAGGTCTCATCGCTCTACCAAATTAAAACCATTTGAAAGAGACCTTTCTTCA | |
224 GATGAG------------------------AATGGTGTCCGT------------------ | |
225 ACACTTAGTACTTATGACTTTAACCCTAATGTACCGCTTGAATATCAAGCTACAAGGGTT | |
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228 GTCTTGACTGATTCTTCTAAGAGGTTTCAGTCATTCCAACAATTTGGTAAAGATGCGTCT | |
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230 TCTTTTGGTGGTGTCAGTGTTATAACACCAGGAACAAACACTTCTTCAGAGGTGGCTGTT | |
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241 AAACCCAGCAAGAGGTCGTTTATTGAAGATTTACTCTTCAATAAAGTCACTCTTGCTGAT | |
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243 TGTGCTCAAAAGTTCAATGGACTCACTGTCTTACCACCATTGCTCACAGATGAAATGATC | |
244 GCTGCTTATACAGCTGCATTAATTAGCGGCACTGCCACTGCTGGATGGACCTTTGGTGCT | |
245 GGTGCTGCTCTTCAAATACCATTTGCCATGCAAATGGCTTATAGATTTAATGGAATTGGA | |
246 GTTACTCAGAATGTTCTCTATGAGAATCAGAAATTAATAGCCAATCAGTTTAATAGTGCT | |
247 ATTGGAAAAATCCAAGAGTCTTTGACATCTACAGCTAGTGCACTTGGAAAATTGCAGGAT | |
248 GTTGTTAACCAAAATGCACAAGCTTTAAACACGCTTGTTAAACAACTTAGTTCCAATTTT | |
249 GGTGCAATTTCAAGCGTGTTGAATGATATTCTTTCACGCCTTGACAAAGTCGAGGCTGAG | |
250 GTTCAGATTGATAGGTTGATCACAGGTAGACTTCAGAGTTTACAGACGTATGTGACTCAA | |
251 CAATTAATCAGAGCTGCAGAAATCAGAGCTTCTGCTAATCTTGCTGCGACTAAAATGTCC | |
252 GAGTGTGTACTAGGACAATCTAAAAGAGTTGATTTTTGTGGAAAAGGTTATCACCTAATG | |
253 TCTTTTCCCCAGTCAGCGCCTCATGGTGTTGTTTTCTTACATGTGACTTACATTCCTTCG | |
254 CAAGAAAAGAACTTCACAACAGCTCCTGCCATTTGTCATGAAGGTAAAGCACACTTCCCA | |
255 CGTGAAGGTGTTTTCGTTTCGAATGGCACACACTGGTTTGTAACACAAAGGAACTTTTAC | |
256 GAACCCCAAATTATAACCACTGACAATACATTTGTCTCCGGTAACTGTGATGTTGTAATT | |
257 GGAATTATCAATAACACAGTTTATGATCCTTTACAACCAGAACTTGATTCATTTAAGGAG | |
258 GAGTTAGATAAATATTTTAAAAATCATACATCACCTGATATTGATCTTGGTGATATTTCT | |
259 GGCATTAATGCTTCTGTTGTCAATATTCAAAAGGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTTGCC | |
260 AGAAATTTAAATGAATCACTCATTGATCTCCAAGAACTTGGAAAATATGAGCACTATATC | |
261 AAATGGCCATGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTCATTGCTATAGTCATGGTT | |
262 ACAATCCTGCTTTGTTGCATGACAAGTTGTTGCAGTTGTCTCAAGGGCTGTTGTTCTTGC | |
263 GGATTTTGCTGTAAATTTGATGAAGATGACTCTGAGCCTGTGCTCAAAGGAGTCAAATTA | |
264 CATTACACGTAA | |
265 > AY304488.1 SARS coronavirus SZ16, complete genome | |
266 ATG---TTTATTTTCTTATTATTT---CTTACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT | |
267 GACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCT | |
268 ATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAG | |
269 GATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATT------------ | |
270 ---------AATCATACGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTT | |
271 GCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAAC | |
272 AAGTCACAGTCGGTGATTATTATTAACAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAAC | |
273 TTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTT------------TCTAAACCCATGGGT | |
274 ACACAGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCT | |
275 GATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTT | |
276 GTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTA | |
277 GTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGGT | |
278 ATTAAAATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTTACCT--------------- | |
279 ---------GCTCAAGATACTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTA | |
280 AAGCCAACTAAATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGAT | |
281 TGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAA | |
282 GGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAGGAGATGTTGTGAGATTCCCT | |
283 AATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTC | |
284 TATGCATGGGAGAGGAAAAGAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAAC | |
285 TCAACATCTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTT | |
286 TGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATA | |
287 GCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATG | |
288 GGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAAT | |
289 TATAAATATAGGTATCTTAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAAT | |
290 GTGCCTTTCTCCCCTGATGGCAAACCTTGCACCCCACCTGCT---CTTAATTGTTATTGG | |
291 CCATTAAAAGATTATGGTTTTTACACCACTAGTGGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTT | |
292 GTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCC | |
293 ACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGT | |
294 GTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCT | |
295 GATATCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGC | |
296 TCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTT | |
297 CTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTCCTACAGCAATTCATGCAGATCAACTCACA | |
298 CCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTT | |
299 ATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATT | |
300 TGTGCTAGTTACCATACAGTTTCT------------TCATTACGTAGTACTAGCCAAAAA | |
301 TCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAAC | |
302 ACCATTGCTATACCTACTAACTTTTTAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCT | |
303 ATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCT | |
304 AATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCGCACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATT | |
305 GCTGTTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAA | |
306 ACCCCAACTTTGAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTA | |
307 AAGCCAACTAAGAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGAT | |
308 GCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATT | |
309 TGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATT | |
310 GCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCT | |
311 GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA | |
312 GTTGCCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCG | |
313 ATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGAC | |
314 GTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTT | |
315 GGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCTCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAG | |
316 GTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAA | |
317 CAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCT | |
318 GAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGCGGAAAGGGCTACCACCTTATG | |
319 TCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCC | |
320 CAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCT | |
321 CGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTT | |
322 TCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATT | |
323 GGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAA | |
324 GAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCA | |
325 GGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAGAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCT | |
326 AAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATT | |
327 AAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTT | |
328 ACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT | |
329 GGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA | |
330 CATTACACATAA | |
331 > EU371564.1 SARS coronavirus BJ182-12, complete genome | |
332 ATG---TTTATTTTCTTATTATTT---CTTACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT | |
333 GACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCT | |
334 ATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAG | |
335 GATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATT------------ | |
336 ---------AATCATACGTTTGGCAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTT | |
337 GCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAAC | |
338 AAGTCACAGTCGGTGATTATTATTAACAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAAC | |
339 TTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTT------------TCTAAACCCATGGGT | |
340 ACACAGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCT | |
341 GATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTT | |
342 GTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTA | |
343 GTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGGT | |
344 ATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTCACCT--------------- | |
345 ---------GCTCAAGACATTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTA | |
346 AAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGAT | |
347 TGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAA | |
348 GGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAGGAGATGTTGTGAGATTCCCT | |
349 AATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTC | |
350 TATGCATGGGAGAGAAAAAAAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAAC | |
351 TCAACATTTTTTTCAACCTTTAAGTGTTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTT | |
352 TGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATA | |
353 GCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATG | |
354 GGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAAT | |
355 TATAAATATAGGTATCTTAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAAT | |
356 GTGCCTTTCTCCCCTGATGGCAAACCTTGCACCCCACCTGCT---CTTAATTGTTATTGG | |
357 CCATTAAATGATTATGGTTTTTACACCACTACTGGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTT | |
358 GTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCC | |
359 ACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGT | |
360 GTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCT | |
361 GATTTCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGC | |
362 TCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTT | |
363 CTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTTCTACAGCAATTCATGCAGATCAACTCACA | |
364 CCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTT | |
365 ATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATT | |
366 TGTGCTAGTTACCATACAGTTTCT------------TTATTACGTAGTACTAGCCAAAAA | |
367 TCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAAC | |
368 ACCATTGCTATACCTACTAACTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCT | |
369 ATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCT | |
370 AATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCACACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATT | |
371 GCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAA | |
372 ACCCCAACTTTGAAATATTTTGATGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTA | |
373 AAGCCAATTAAAAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGAT | |
374 GCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATT | |
375 TGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATT | |
376 GCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCT | |
377 GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA | |
378 GTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCG | |
379 ATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGAC | |
380 GTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTT | |
381 GGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAG | |
382 GTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAA | |
383 CAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCT | |
384 GAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGTGGAAAGGGCTACCACCTTATG | |
385 TCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCC | |
386 CAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCT | |
387 CGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTT | |
388 TCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATT | |
389 GGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAA | |
390 GAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCA | |
391 GGCATTAACGCTCCTGTCGTCAACATTCAAAAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCT | |
392 AAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCGAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATT | |
393 AAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTT | |
394 ACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT | |
395 GGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA | |
396 CATTACACATAA | |
397 > MK211376.1 Coronavirus BtRs-BetaCoV/YN2018B, complete genome | |
398 ATGAAATTGTTAGTTTTAGTTTTT---GCTACTTTGGTCTCTTCTTAC------ACTATA | |
399 GAGAAGTGCACTGACTTTGATGATCGCACTCCACCTTCAAACACTCAATTTCTGTCTTCT | |
400 CACAGAGGTGTTTATTACCCAGATGATATTTTTAGGTCTAATGTCTTGCATTTAGTACAA | |
401 GATCACTTTCTACCTTTTGACTCTAATGTCACTAGGTTTATAACATTT------------ | |
402 ---------GGCCTAAATTTTGATAATCCCATAATACCCTTTAGGGATGGTGTTTACTTT | |
403 GCTGCGACTGAAAAGTCTAATGTTATTAGAGGATGGGTTTTTGGTTCTACAATGAACAAT | |
404 AAATCTCAATCCGTTATAATAATGAACAACTCAACTAATTTAGTCATTAGGGCTTGTAAT | |
405 TTTGAGTTGTGTGACAATCCATTCTTTGTTGTG------------TTGAGATCCAACAAC | |
406 ACTCAGATACCGTCTTACATATTCAATAATGCATTCAATTGCACATTTGAATATGTTTCT | |
407 AAGGATTTTAACCTTGACATTGGTGAAAAACCAGGTAATTTCAAGGATCTTAGAGAGTTT | |
408 GTTTTCAGGAATAAAGATGGTTTTTTGCATGTTTACTCTGGTTACCAACCCATTTCTGCT | |
409 GCTAGTGGCTTGCCAACTGGTTTTAATGCACTTAAACCTATTTTTAAGTTACCTCTGGGT | |
410 ATTAATATTACTAATTTCAGAACTCTTCTGACTGCTTTTCCTCCT--------------- | |
411 ---------AACCCTGGTTATTGGGGTACTTCAGCTGCAGCTTATTTTGTAGGATATTTA | |
412 AAGCCAACTACATTCATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTCGAT | |
413 TGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAAAGTTTTGAGATTGACAAA | |
414 GGAATTTACCAAACCTCCAATTTTAGGGTAGCACCCTCAAAGGAAGTTGTGAGGTTCCCT | |
415 AATATTACAAACCTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTACATTTCCTTCTGTC | |
416 TATGCATGGGAGAGGAAAAGAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTACTCTACAAC | |
417 TCAACATCTTTTTCAACTTTTAAGTGTTATGGCGTTTCTGCCACTAAGCTGAATGATCTT | |
418 TGCTTCTCTAATGTCTATGCAGATTCATTCGTAGTCAAAGGAGATGATGTAAGGCAAATA | |
419 GCACCAGGACAGACCGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTTATG | |
420 GGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAAT | |
421 TATAAATATAGATCTCTCAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATTTCTAAT | |
422 GTGCCTTTCTCCCCTGATGGCAAACCATGTACCCCACCTGCT---TTCAACTGTTACTGG | |
423 CCATTAAATGATTATGGTTTTTTCACTACTAATGGCATAGGCTATCAACCCTATAGAGTT | |
424 GTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCTGCTACAGTCTGTGGACCAAAATTATCC | |
425 ACTGACCTTATTAAAAACCAGTGTGTCAATTTTAACTTTAATGGACTCACTGGTACTGGT | |
426 GTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGTCGTGATGTTTCG | |
427 GATTTCACTGATTCAGTTCGAGATCCTAAAACGTCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGC | |
428 TCTTTTGGCGGTGTAAGTGTAATTACACCCGGAACAAATACTTCATCAGAAGTTGCTGTT | |
429 CTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTCCTGTAGCAATCCATGCAGACCAACTCACA | |
430 CCTGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAATAATGTATTTCAAACTCAGGCAGGCTGTCTT | |
431 ATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATT | |
432 TGTGCTAGTTACCACACAGTTTCT------------TCACTACGTAGTACTAGCCAAAAA | |
433 TCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAAC | |
434 ACCATTGCTATACCTACTAATTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCT | |
435 ATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGCGATTCTACTGAATGTGCT | |
436 AATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCACACAATTAAATCGTGCACTCTCAGGTATC | |
437 GCTGTTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTGAAACAAATGTACAAA | |
438 ACCCCAACTTTGAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTA | |
439 AAGCCAACTAAGAGATCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGAT | |
440 GCTGGCTTTATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATT | |
441 TGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTTTGCTCACTGATGATATGATT | |
442 GCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTCAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCT | |
443 GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA | |
444 GTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCG | |
445 ATCAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGAC | |
446 GTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTCAAACAACTTAGCTCCAATTTT | |
447 GGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTCTCGCGACTTGACAAAGTCGAGGCTGAG | |
448 GTACAAATTGATAGGTTAATTACAGGCAGACTGCAAAGCCTGCAAACCTATGTAACACAA | |
449 CAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCT | |
450 GAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGCGGAAAAGGCTATCATCTTATG | |
451 TCCTTCCCGCAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACATATGTGCCATCC | |
452 CAAGAGAGAAACTTCACCACTGCGCCAGCAATTTGTCACGAAGGCAAAGCATACTTCCCG | |
453 CGTGAAGGTGTTTTTGTTTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTT | |
454 TCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCCGGAAGTTGTGATGTCGTAATC | |
455 GGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAA | |
456 GAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCACACATCACCAGATGTTGATCTCGGCGACATTTCA | |
457 GGCATTAACGCTTCTGTCGTCAATATTCAGAAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCC | |
458 AAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATACATT | |
459 AAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTT | |
460 ACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT | |
461 GGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA | |
462 CATTACACATAA | |
463 > KY417146.1 Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4231, complete genome | |
464 ATG---TTTATTTTCTTATTCTTT---CTCACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT | |
465 GAGAGTTGTACCACTTTTGATGATGTTCAAGCCCCTAATTACCCTCAACACTCTTCATCC | |
466 AGGAGAGGGGTTTATTATCCTGATGAAATCTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAG | |
467 GATCTATTTCTTCCATTCTATTCTAATGTCACAGGGTTTCATACTATT------------ | |
468 ---------AATCATAGGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTGTTTATTTT | |
469 GCTGCCACTGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGCTCTACCATGAACAAC | |
470 AAGTCTCAGTCGGTGATTATCATCAATAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAAT | |
471 TTTGAGTTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTC------------TCTAAACCTACGGGA | |
472 ACACAGACACACACTATGATATTCGACAATGCATTTAATTGCACTTTCGAATACATATCA | |
473 GACTCCTTTTCGCTCGATGTTGCTGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTT | |
474 GTGTTTAAAAATAAGGATGGGTTTCTCTATGTTTACAAGGGTTATCAACCTATAGACGTA | |
475 GTCCGTGATCTACCATCTGGCTTTAATATTTTGAAACCTATTTTTAAGTTACCTCTTGGT | |
476 ATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCATTTTTGCCT--------------- | |
477 ---------GCTCAAGACACTTGGGGTACATCAGCTGCTGCTTATTTTGTTGGCTATTTA | |
478 AAGCCAGCTACATTCATGCTTAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGAT | |
479 TGTTCTCAAAATCCCCTTGCTGAACTCAAATGTTCTGTTAAAAGTTTTGAGATTGATAAA | |
480 GGAATTTACCAAACCTCCAATTTTAGGGTAGCACCCTCAAAGGAAGTTGTGAGGTTCCCT | |
481 AATATTACAAACCTGTGTCCTTTTGGGGAGGTTTTTAATGCTACTACATTTCCTTCTGTC | |
482 TATGCATGGGAGAGGAAAAGAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTACTCTACAAC | |
483 TCAACATCTTTTTCAACTTTTAAGTGTTATGGCGTTTCTGCCACTAAGCTGAATGACCTT | |
484 TGCTTCTCCAACGTCTATGCAGATTCATTCGTAGTCAAAGGAGATGATGTAAGGCAAATA | |
485 GCACCAGGACAGACCGGTGTTATTGCTGATTATAATTACAAATTACCAGATGACTTCTTG | |
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488 GACATCTATTCACCTGGAGGTCAGTCTTGCTCAGCTATAGGT---CCTAATTGTTATAAC | |
489 CCCTTACGTCCATATGGCTTTTTTACAACAGCTGGTGTTGGACACCAACCTTATAGAGTT | |
490 GTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCCGCTACAGTCTGTGGACCAAAATTATCC | |
491 ACTGACCTTATTAAAAACCAGTGTGTCAATTTTAACTTTAATGGACTCACTGGTACTGGT | |
492 GTGTTAACTTCTTCCTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGTCGTGATGTTTCG | |
493 GATTTCACTGATTCAGTTCGAGACCCGAAGACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGC | |
494 TCTTTTGGCGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATACTTCATCAGAAGTTGCTGTT | |
495 CTATATCAAGATGTTAATTGCACTGATGTTCCTGTAGCAATCCATGCAGACCAACTCACA | |
496 CCTGCTTGGCGCATATACTCTACTGGAAATAATGTATTTCAAACTCAGGCAGGCTGTCTT | |
497 ATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATT | |
498 TGTGCTAGTTACCACACAGTTTCT------------TCACTACGTAGTACTAGCCAAAAA | |
499 TCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAAC | |
500 ACCATTGCTATACCTACTAATTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCT | |
501 ATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGCGATTCTACTGAATGTGCT | |
502 AATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCACACAATTAAATCGTGCACTCTCAGGTATC | |
503 GCTGTCGAACAGGACCGCAACACGCGTGAAGTGTTCGCTCAAGTGAAACAGATGTACAAA | |
504 ACCCCAGCTTTGAAAGATTTCGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTA | |
505 AAGCCAACTAAGAGATCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGAT | |
506 GCTGGCTTTATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATGTTAATGCTAGAGATCTCATT | |
507 TGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATT | |
508 GCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCT | |
509 GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA | |
510 GTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAATCAATTTAATAAGGCG | |
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513 GGTGCTATTTCAAGTGTGTTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAG | |
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520 TCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCTGGGAGTTGTGATGTCGTAATT | |
521 GGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAA | |
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526 ACAATCTTGCTTTGCTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT | |
527 GGTTCTTGCTGCAAATTTGATGAGGATGACTCTGAGCCGGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA | |
528 CATTACACATAA | |
529 > AY395003.1 SARS coronavirus ZS-C, complete genome | |
530 ATG---TTTATTTTCTTATTATTT---CTTACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT | |
531 GACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCT | |
532 ATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAG | |
533 GATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATT------------ | |
534 ---------AATCATAGGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTT | |
535 GCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAAC | |
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537 TTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTT------------TCTAAACCCATGGGT | |
538 ACACAGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCT | |
539 GATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTT | |
540 GTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTA | |
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544 AAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGAT | |
545 TGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAA | |
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547 AATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTC | |
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549 TCAACATTTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTT | |
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569 GCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAA | |
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575 GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA | |
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593 GGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA | |
594 CATTACACATAA | |
595 > AY278554.2 SARS coronavirus CUHK-W1, complete genome | |
596 ATG---TTTATTTTCTTATTATTT---CTTACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT | |
597 GACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCT | |
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610 AAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGAT | |
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615 TCAACATTTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTT | |
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625 GATTTCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGC | |
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632 ACCATTGCTATACCTACTAACTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCT | |
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635 GCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAA | |
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639 TGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATT | |
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641 GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA | |
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643 ATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGAC | |
644 GTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTT | |
645 GGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAG | |
646 GTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAA | |
647 CAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCT | |
648 GAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGTGGAAAGGGCTACCACCTTATG | |
649 TCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCC | |
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651 CGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTT | |
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655 GGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAAAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCT | |
656 AAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATT | |
657 AAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTT | |
658 ACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT | |
659 GGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA | |
660 CATTACACATAA | |
661 > AY394985.1 SARS coronavirus HSZ-Bb, complete genome | |
662 ATG---TTTATTTTCTTATTATTT---CTTACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT | |
663 GACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCT | |
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665 GATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATT------------ | |
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672 GTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTA | |
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675 ---------GCTCAAGACACTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTA | |
676 AAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGAT | |
677 TGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAA | |
678 GGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAGGAGATGTTGTGAGATTCCCT | |
679 AATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTC | |
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681 TCAACATTTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTT | |
682 TGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATA | |
683 GCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATG | |
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691 GATTTCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGC | |
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695 ATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATT | |
696 TGTGCTAGTTACCATACAGTTTCT------------TTATTACGTAGTACTAGCCAAAAA | |
697 TCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAAC | |
698 ACCATTGCTATACCTACTAACTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCT | |
699 ATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCT | |
700 AATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCACACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATT | |
701 GCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAA | |
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703 AAGCCAACTAAGAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGAT | |
704 GCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATT | |
705 TGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATT | |
706 GCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCT | |
707 GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA | |
708 GTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCG | |
709 ATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGAC | |
710 GTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTT | |
711 GGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAG | |
712 GTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAA | |
713 CAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCT | |
714 GAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGTGGAAAGGGCTACCACCTTATG | |
715 TCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCC | |
716 CAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCT | |
717 CGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTT | |
718 TCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATT | |
719 GGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAA | |
720 GAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCA | |
721 GGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAGAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCT | |
722 AAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATT | |
723 AAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTT | |
724 ACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT | |
725 GGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA | |
726 CATTACACATAA | |
727 > AY390556.1 SARS coronavirus GZ02, complete genome | |
728 ATG---TTTATTTTCTTATTATTT---CTTACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT | |
729 GACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCT | |
730 ATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAG | |
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743 TGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAA | |
744 GGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAAGAGATGTTGTGAGATTCCCT | |
745 AATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTC | |
746 TATGCATGGGAGAGGAAAAGAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAAC | |
747 TCAACATTTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTT | |
748 TGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATA | |
749 GCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATG | |
750 GGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAAT | |
751 TATAAATATAGGTATCTTAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAAT | |
752 GTGCCTTTCTCCCCTGATGGCAAACCTTGCACCCCACCTGCT---CTTAATTGTTATTGG | |
753 CCATTAAATGATTATGGTTTTTACACCACTACTGGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTT | |
754 GTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCC | |
755 ACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGT | |
756 GTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCT | |
757 GATTTCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGC | |
758 TCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTT | |
759 CTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTTCTACAGCAATTCATGCAGATCAACTCACA | |
760 CCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTT | |
761 ATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATT | |
762 TGTGCTAGTTACCATACAGTTTCT------------TTATTACGTAGTACTAGCCAAAAA | |
763 TCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAAC | |
764 ACCATTGCTATACCTACTAACTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCT | |
765 ATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCT | |
766 AATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCACACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATT | |
767 GCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAA | |
768 ACCCCAACTTTGAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTA | |
769 AAGCCAACTAAGAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGAT | |
770 GCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATT | |
771 TGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATT | |
772 GCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCT | |
773 GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA | |
774 GTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCG | |
775 ATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGAC | |
776 GTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTT | |
777 GGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAG | |
778 GTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAA | |
779 CAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCT | |
780 GAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGCGGAAAGGGCTACCACCTTATG | |
781 TCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCC | |
782 CAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCT | |
783 CGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTT | |
784 TCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATT | |
785 GGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAA | |
786 GAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCA | |
787 GGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAGAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCT | |
788 AAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATT | |
789 AAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTT | |
790 ACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT | |
791 GGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA | |
792 CATTACACATAA |