comparison test-data/NC_012920.fas @ 0:39b6485e2d34 draft

"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/mitos commit 791f28c8a7194fdd1ecec05ad166932d461899b2"
author iuc
date Fri, 27 Mar 2020 17:53:04 -0400
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equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:39b6485e2d34
1 >NC_012920; 577-647; +; trnF(gaa)
2 GTTTATGTAGCTTACCTCCTCAAAGCAATACACTGAAAATGTTTAGACGGGCTCACATCA
3 CCCCATAAACA
4 >NC_012920; 1602-1670; +; trnV(tac)
5 CAGAGTGTAGCTTAACACAAAGCACCCAACTTACACTTAGGAGATTTCAACTTAACTTGA
6 CCGCTCTGA
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8 GTTAAGATGGCAGAGCCCGGTAATCGCATAAAACTTAAAACTTTACAGTCAGAGGTTCAA
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11 AGAAATATGTCTGATAAAAGAGTTACTTTGATAGAGTAAATAATAGGAGCTTAAACCCCC
12 TTATTTCTA
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14 TAGGATGGGGTGTGATAGGTGGCACGGAGAATTTTGGATTCTCAGGGATGGGTTCGATTC
15 TCATAGTCCTAG
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17 AGTAAGGTCAGCTAAATAAGCTATCGGGCCCATACCCCGAAAATGTTGGTTATACCCTTC
18 CCGTACTA
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20 AGAAATTTAGGTTAAATACAGACCAAGAGCCTTCAAAGCCCTCAGTAAGTTGCAATACTT
21 AATTTCTG
22 >NC_012920; 5587-5655; -; trnA(tgc)
23 AAGGGCTTAGCTTAATTAAAGTGGCTGATTTGCGTTCAGTTGATGCAGAGTGGGGTTTTG
24 CAGTCCTTA
25 >NC_012920; 5659-5721; -; trnN(gtt)
26 AGCCAGTTGATTAGGGTGCTTAGCTGTTAACTAAGTGTTTGTGGGTTTAAGTCCCATTGG
27 TCT
28 >NC_012920; 5761-5826; -; trnC(gca)
29 AGCTCCGAGGTGATTTTCATATTGAATTGCAAATTCGAAGAAGCAGCTTCAAACCTGCCG
30 GGGCTT
31 >NC_012920; 5761-5826; -; rrnS
32 AGCTCCGAGGTGATTTTCATATTGAATTGCAAATTCGAAGAAGCAGCTTCAAACCTGCCG
33 GGGCTT
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35 GGTAAAATGGCTGAGTGAAGCATTGGACTGTAAATCTAAAGACAGGGGTTAGGCCTCTTT
36 TTACC
37 >NC_012920; 7446-7514; -; trnS2(tga)
38 GAAAAAGTCATGGAGGCCATGGGGTTGGCTTGAAACCAGCTTTGGGGGGTTCGATTCCTT
39 CCTTTTTTG
40 >NC_012920; 7518-7585; +; trnD(gtc)
41 AAGGTATTAGAAAAACCATTTCATAACTTTGTCAAAGTTAAATTATAGGCTAAATCCTAT
42 ATATCTTA
43 >NC_012920; 7518-7585; +; rrnL
44 AAGGTATTAGAAAAACCATTTCATAACTTTGTCAAAGTTAAATTATAGGCTAAATCCTAT
45 ATATCTTA
46 >NC_012920; 8295-8364; +; trnK(ttt)
47 CACTGTAAAGCTAACTTAGCATTAACCTTTTAAGTTAAAGATTAAGAGAACCAACACCTC
48 TTTACAGTGA
49 >NC_012920; 9991-10058; +; trnG(tcc)
50 ACTCTTTTAGTATAAATAGTACCGTTAACTTCCAATTAACTAGTTTTGACAACATTCAAA
51 AAAGAGTA
52 >NC_012920; 10405-10469; +; trnR(tcg)
53 TGGTATATAGTTTAAACAAAACGAATGATTTCGACTCATTAAATTATGATAATCATATTT
54 ACCAA
55 >NC_012920; 12138-12206; +; trnH(gtg)
56 GTAAATATAGTTTAACCAAAACATCAGATTGTGAATCTGACAACAGAGGCTTACGACCCC
57 TTATTTACC
58 >NC_012920; 12266-12336; +; trnL1(tag)
59 ACTTTTAAAGGATAACAGCTATCCATTGGTCTTAGGCCCCAAAAATTTTGGTGCAACTCC
60 AAATAAAAGTA
61 >NC_012920; 12770-12817; -; rrnS
62 GGGCGTATCATCAACTGATGAGCAAGAAGGATATAATTCCTACGCCCT
63 >NC_012920; 14155-14673; -; nad6
64 ATGATGTATGCTTTGTTTCTGTTGAGTGTGGGTTTAGTAATGGGGTTTGTGGGGTTTTCT
65 TCTAAGCCTTCTCCTATTTATGGGGGTTTAGTATTGATTGTTAGCGGTGTGGTCGGGTGT
66 GTTATTATTCTGAATTTTGGGGGAGGTTATATGGGTTTAATAGTTTTTTTAATTTATTTA
67 GGGGGAATGATGGTTGTCTTTGGATATACTACAGCGATGGCTATTGAGGAGTATCCTGAG
68 GCATGGGGGTCAGGGGTTGAGGTCTTGGTGAGTGTTTTAGTGGGGTTAGCGATGGAGGTA
69 GGATTGGTGCTGTGGGTGAAAGAGTATGATGGGGTGGTGGTTGTGGTAAACTTTAATAGT
70 GTAGGAAGCTGAATAATTTATGAAGGAGAGGGGTCAGGGTTGATTCGGGAGGATCCTATT
71 GGTGCGGGGGCTTTGTATGATTATGGGCGTTGATTAGTAGTAGTTACTGGTTGAACATTG
72 TTTGTTGGTGTATATATTGTAATTGAGATTGCTCGGGGG
73 >NC_012920; 14674-14742; -; trnE(ttc)
74 GTTCTTGTAGTTGAAATACAACGATGGTTTTTCATATCATTGGTCGTGGTTGTAGTCCGT
75 GCGAGAATA
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79 >NC_012920; 15956-16023; -; trnP(tgg)
80 CAGAGAATAGTTTAAATTAGAATCTTAGCTTTGGGTGCTAATGGTGGAGTTAAAGACTTT
81 TTCTCTGA