Mercurial > repos > iuc > mitos

diff test-data/NC_012920.fas @ 0:39b6485e2d34 draft
"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/mitos commit 791f28c8a7194fdd1ecec05ad166932d461899b2"
author: iuc
date: Fri, 27 Mar 2020 17:53:04 -0400
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/NC_012920.fas	Fri Mar 27 17:53:04 2020 -0400
@@ -0,0 +1,81 @@
+>NC_012920; 577-647; +; trnF(gaa)
+GTTTATGTAGCTTACCTCCTCAAAGCAATACACTGAAAATGTTTAGACGGGCTCACATCA
+CCCCATAAACA
+>NC_012920; 1602-1670; +; trnV(tac)
+CAGAGTGTAGCTTAACACAAAGCACCCAACTTACACTTAGGAGATTTCAACTTAACTTGA
+CCGCTCTGA
+>NC_012920; 3230-3304; +; trnL2(taa)
+GTTAAGATGGCAGAGCCCGGTAATCGCATAAAACTTAAAACTTTACAGTCAGAGGTTCAA
+TTCCTCTTCTTAACA
+>NC_012920; 4263-4331; +; trnI(gat)
+AGAAATATGTCTGATAAAAGAGTTACTTTGATAGAGTAAATAATAGGAGCTTAAACCCCC
+TTATTTCTA
+>NC_012920; 4329-4400; -; trnQ(ttg)
+TAGGATGGGGTGTGATAGGTGGCACGGAGAATTTTGGATTCTCAGGGATGGGTTCGATTC
+TCATAGTCCTAG
+>NC_012920; 4402-4469; +; trnM(cat)
+AGTAAGGTCAGCTAAATAAGCTATCGGGCCCATACCCCGAAAATGTTGGTTATACCCTTC
+CCGTACTA
+>NC_012920; 5512-5579; +; trnW(tca)
+AGAAATTTAGGTTAAATACAGACCAAGAGCCTTCAAAGCCCTCAGTAAGTTGCAATACTT
+AATTTCTG
+>NC_012920; 5587-5655; -; trnA(tgc)
+AAGGGCTTAGCTTAATTAAAGTGGCTGATTTGCGTTCAGTTGATGCAGAGTGGGGTTTTG
+CAGTCCTTA
+>NC_012920; 5659-5721; -; trnN(gtt)
+AGCCAGTTGATTAGGGTGCTTAGCTGTTAACTAAGTGTTTGTGGGTTTAAGTCCCATTGG
+TCT
+>NC_012920; 5761-5826; -; trnC(gca)
+AGCTCCGAGGTGATTTTCATATTGAATTGCAAATTCGAAGAAGCAGCTTCAAACCTGCCG
+GGGCTT
+>NC_012920; 5761-5826; -; rrnS
+AGCTCCGAGGTGATTTTCATATTGAATTGCAAATTCGAAGAAGCAGCTTCAAACCTGCCG
+GGGCTT
+>NC_012920; 5827-5891; -; trnY(gta)
+GGTAAAATGGCTGAGTGAAGCATTGGACTGTAAATCTAAAGACAGGGGTTAGGCCTCTTT
+TTACC
+>NC_012920; 7446-7514; -; trnS2(tga)
+GAAAAAGTCATGGAGGCCATGGGGTTGGCTTGAAACCAGCTTTGGGGGGTTCGATTCCTT
+CCTTTTTTG
+>NC_012920; 7518-7585; +; trnD(gtc)
+AAGGTATTAGAAAAACCATTTCATAACTTTGTCAAAGTTAAATTATAGGCTAAATCCTAT
+ATATCTTA
+>NC_012920; 7518-7585; +; rrnL
+AAGGTATTAGAAAAACCATTTCATAACTTTGTCAAAGTTAAATTATAGGCTAAATCCTAT
+ATATCTTA
+>NC_012920; 8295-8364; +; trnK(ttt)
+CACTGTAAAGCTAACTTAGCATTAACCTTTTAAGTTAAAGATTAAGAGAACCAACACCTC
+TTTACAGTGA
+>NC_012920; 9991-10058; +; trnG(tcc)
+ACTCTTTTAGTATAAATAGTACCGTTAACTTCCAATTAACTAGTTTTGACAACATTCAAA
+AAAGAGTA
+>NC_012920; 10405-10469; +; trnR(tcg)
+TGGTATATAGTTTAAACAAAACGAATGATTTCGACTCATTAAATTATGATAATCATATTT
+ACCAA
+>NC_012920; 12138-12206; +; trnH(gtg)
+GTAAATATAGTTTAACCAAAACATCAGATTGTGAATCTGACAACAGAGGCTTACGACCCC
+TTATTTACC
+>NC_012920; 12266-12336; +; trnL1(tag)
+ACTTTTAAAGGATAACAGCTATCCATTGGTCTTAGGCCCCAAAAATTTTGGTGCAACTCC
+AAATAAAAGTA
+>NC_012920; 12770-12817; -; rrnS
+GGGCGTATCATCAACTGATGAGCAAGAAGGATATAATTCCTACGCCCT
+>NC_012920; 14155-14673; -; nad6
+ATGATGTATGCTTTGTTTCTGTTGAGTGTGGGTTTAGTAATGGGGTTTGTGGGGTTTTCT
+TCTAAGCCTTCTCCTATTTATGGGGGTTTAGTATTGATTGTTAGCGGTGTGGTCGGGTGT
+GTTATTATTCTGAATTTTGGGGGAGGTTATATGGGTTTAATAGTTTTTTTAATTTATTTA
+GGGGGAATGATGGTTGTCTTTGGATATACTACAGCGATGGCTATTGAGGAGTATCCTGAG
+GCATGGGGGTCAGGGGTTGAGGTCTTGGTGAGTGTTTTAGTGGGGTTAGCGATGGAGGTA
+GGATTGGTGCTGTGGGTGAAAGAGTATGATGGGGTGGTGGTTGTGGTAAACTTTAATAGT
+GTAGGAAGCTGAATAATTTATGAAGGAGAGGGGTCAGGGTTGATTCGGGAGGATCCTATT
+GGTGCGGGGGCTTTGTATGATTATGGGCGTTGATTAGTAGTAGTTACTGGTTGAACATTG
+TTTGTTGGTGTATATATTGTAATTGAGATTGCTCGGGGG
+>NC_012920; 14674-14742; -; trnE(ttc)
+GTTCTTGTAGTTGAAATACAACGATGGTTTTTCATATCATTGGTCGTGGTTGTAGTCCGT
+GCGAGAATA
+>NC_012920; 15888-15953; +; trnT(tgt)
+GTCCTTGTAGTATAAACTAATACACCAGTCTTGTAAACCGGAGATGAAAACCTTTTTCCA
+AGGACA
+>NC_012920; 15956-16023; -; trnP(tgg)
+CAGAGAATAGTTTAAATTAGAATCTTAGCTTTGGGTGCTAATGGTGGAGTTAAAGACTTT
+TTCTCTGA