comparison test-data/SE_g2.G.bed @ 0:26d7ec4af119 draft

"planemo upload for repository https://github.com/sunnyisgalaxy/moabs commit fca680a439f168971afc9944ccbbdd9b3b65c845"
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date Fri, 06 Sep 2019 09:54:27 -0400
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2 chr11 41 43 0 3 0 - G + 0 0 - 3 0 GCGGC
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6 chr11 101 103 0.143 7 1 B G + 2 0 - 5 1 GTCGC
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8 chr11 144 146 0.1 10 1 B G + 3 1 - 7 0 AACGG
9 chr11 210 212 0.417 12 5 B G + 3 2 - 9 3 CCCGA
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177 chr11 5227 5229 0.111 9 1 B G + 6 1 - 3 0 CCCGC
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180 chr11 5282 5284 0 12 0 B G + 4 0 - 8 0 GCCGC
181 chr11 5285 5287 0.167 12 2 B G + 4 1 - 8 1 GCCGA
182 chr11 5291 5293 0.0769 13 1 B G + 4 0 - 9 1 GGCGA
183 chr11 5300 5302 0 13 0 B G + 4 0 - 9 0 ACCGG
184 chr11 5318 5320 0.364 11 4 B G + 2 0 - 9 4 TCCGG
185 chr11 5342 5344 0.167 12 2 B G + 3 0 - 9 2 CCCGC
186 chr11 5351 5353 0.429 14 6 B G + 4 0 - 10 6 CTCGC
187 chr11 5379 5381 0 16 0 B G + 6 0 - 10 0 TACGC
188 chr11 5381 5383 0 16 0 B G + 6 0 - 10 0 CGCGC
189 chr11 5394 5396 0.0667 15 1 B G + 6 0 - 9 1 CCCGG
190 chr11 5410 5412 0 21 0 B G + 10 0 - 11 0 GGCGA
191 chr11 5414 5416 0.143 21 3 B G + 10 2 - 11 1 ACCGG
192 chr11 5417 5419 0 20 0 B G + 9 0 - 11 0 GGCGT
193 chr11 5472 5474 0.174 23 4 B G + 13 4 - 10 0 TTCGG
194 chr11 5498 5500 0.143 21 3 B G + 12 3 - 9 0 CCCGG
195 chr11 5532 5534 0.115 26 3 B G + 16 2 - 10 1 CCCGA
196 chr11 5535 5537 0.231 26 6 B G + 17 6 - 9 0 GACGC
197 chr11 5538 5540 0.308 26 8 B G + 17 7 - 9 1 GCCGT
198 chr11 5551 5553 0.348 23 8 B G + 14 5 - 9 3 ACCGT
199 chr11 5564 5566 0 19 0 B G + 12 0 - 7 0 ACCGG
200 chr11 5576 5578 0.0476 21 1 B G + 15 0 - 6 1 TTCGC
201 chr11 5600 5602 0.0833 24 2 B G + 18 1 - 6 1 GTCGG
202 chr11 5622 5624 0.211 19 4 B G + 15 1 - 4 3 GCCGC
203 chr11 5624 5626 0.235 17 4 B G + 13 4 - 4 0 CGCGT
204 chr11 5641 5643 0.0588 17 1 B G + 16 1 - 1 0 CACGA
205 chr11 5667 5669 0.0417 24 1 B G + 22 1 - 2 0 CACGG
206 chr11 5720 5722 0.125 24 3 B G + 20 2 - 4 1 AGCGC
207 chr11 5816 5818 0.238 21 5 B G + 11 5 - 10 0 ACCGT
208 chr11 5828 5830 0.238 21 5 B G + 11 4 - 10 1 CCCGC
209 chr11 5830 5832 0.0455 22 1 B G + 11 0 - 11 1 CGCGC
210 chr11 5843 5845 0.0556 18 1 B G + 8 1 - 10 0 AGCGA
211 chr11 5905 5907 0 2 0 B G + 1 0 - 1 0 CCCGT
212 chr11 5969 5971 0.267 15 4 B G + 7 2 - 8 2 CCCGC
213 chr11 5972 5974 0 15 0 B G + 7 0 - 8 0 GCCGG
214 chr11 6023 6025 0.333 18 6 B G + 8 1 - 10 5 CTCGC
215 chr11 6044 6046 0 12 0 B G + 6 0 - 6 0 TTCGC
216 chr11 6049 6051 0.0833 12 1 B G + 6 1 - 6 0 CCCGC
217 chr11 6076 6078 0 7 0 B G + 1 0 - 6 0 TCCGG
218 chr11 6089 6091 0 10 0 B G + 3 0 - 7 0 CCCGG
219 chr11 6099 6101 0.111 9 1 B G + 3 0 - 6 1 GGCGA
220 chr11 6148 6150 0 13 0 B G + 5 0 - 8 0 ACCGC
221 chr11 6156 6158 0 14 0 B G + 6 0 - 8 0 TTCGA
222 chr11 6164 6166 0 12 0 B G + 7 0 - 5 0 CTCGG
223 chr11 6168 6170 0 14 0 B G + 7 0 - 7 0 GGCGG
224 chr11 6208 6210 0.2 10 2 B G + 6 1 - 4 1 ATCGA
225 chr11 6226 6228 0 10 0 B G + 6 0 - 4 0 AACGC
226 chr11 6239 6241 0 12 0 B G + 7 0 - 5 0 CCCGG
227 chr11 6247 6249 0.0909 11 1 B G + 6 1 - 5 0 GCCGG
228 chr11 6251 6253 0.222 9 2 B G + 4 1 - 5 1 GGCGC
229 chr11 6253 6255 0.111 9 1 B G + 4 0 - 5 1 CGCGG
230 chr11 6258 6260 0.0909 11 1 B G + 5 0 - 6 1 AGCGG
231 chr11 6269 6271 0.0833 12 1 B G + 5 0 - 7 1 GCCGC
232 chr11 6272 6274 0.0909 11 1 B G + 4 0 - 7 1 GCCGC
233 chr11 6282 6284 0.1 10 1 B G + 5 0 - 5 1 CCCGG
234 chr11 6293 6295 0.143 14 2 B G + 6 2 - 8 0 GTCGG
235 chr11 6297 6299 0 13 0 B G + 6 0 - 7 0 GTCGG
236 chr11 6300 6302 0.154 13 2 B G + 6 1 - 7 1 GGCGG
237 chr11 6304 6306 0.0833 12 1 B G + 5 1 - 7 0 GCCGG
238 chr11 6312 6314 0 12 0 B G + 5 0 - 7 0 AGCGC
239 chr11 6314 6316 0.167 12 2 B G + 5 1 - 7 1 CGCGG
240 chr11 6318 6320 0 12 0 B G + 5 0 - 7 0 GGCGT
241 chr11 6321 6323 0 13 0 B G + 5 0 - 8 0 GTCGC
242 chr11 6323 6325 0 12 0 B G + 5 0 - 7 0 CGCGA
243 chr11 6350 6352 0 12 0 B G + 5 0 - 7 0 CTCGG
244 chr11 6356 6358 0.1 10 1 B G + 5 1 - 5 0 TCCGC
245 chr11 6358 6360 0 11 0 B G + 5 0 - 6 0 CGCGC
246 chr11 6365 6367 0 11 0 B G + 6 0 - 5 0 CCCGA
247 chr11 6371 6373 0.0769 13 1 B G + 6 1 - 7 0 CCCGA
248 chr11 6430 6432 0.105 19 2 B G + 11 0 - 8 2 GCCGC
249 chr11 6432 6434 0.105 19 2 B G + 10 0 - 9 2 CGCGG
250 chr11 6442 6444 0.0909 22 2 B G + 12 0 - 10 2 CACGG
251 chr11 6449 6451 0.0417 24 1 B G + 14 1 - 10 0 CTCGA
252 chr11 6491 6493 0.278 18 5 B G + 10 2 - 8 3 CTCGG
253 chr11 6526 6528 0.115 26 3 B G + 12 2 - 14 1 ACCGA
254 chr11 6560 6562 0.233 30 7 B G + 15 1 - 15 6 TCCGT
255 chr11 6596 6598 0.6 30 18 B G + 14 7 - 16 11 GGCGA
256 chr11 6730 6732 0.516 31 16 B G + 9 5 - 22 11 AGCGA
257 chr11 6857 6859 0.239 46 11 B G + 20 6 - 26 5 CTCGG
258 chr11 6900 6902 0.804 46 37 B G + 22 19 - 24 18 TGCGC
259 chr11 6902 6904 0.804 46 37 B G + 22 18 - 24 19 CGCGC
260 chr11 6979 6981 0.487 39 19 B G + 20 11 - 19 8 TACGT
261 chr11 7085 7087 0.704 27 19 B G + 14 10 - 13 9 AGCGG
262 chr11 7166 7168 0.259 27 7 B G + 19 7 - 8 0 TTCGG
263 chr11 7336 7338 0.769 13 10 B G + 11 9 - 2 1 GCCGG
264 chr11 7583 7585 0.176 34 6 B G + 7 1 - 27 5 GGCGT
265 chr11 7633 7635 0.154 26 4 B G + 7 3 - 19 1 CTCGC
266 chr11 7655 7657 0.143 21 3 B G + 6 0 - 15 3 TACGA
267 chr11 7673 7675 0 17 0 B G + 4 0 - 13 0 AGCGT
268 chr11 7679 7681 0.0476 21 1 B G + 7 0 - 14 1 GTCGA
269 chr11 7688 7690 0.167 18 3 B G + 8 0 - 10 3 GCCGA
270 chr11 7695 7697 0 21 0 B G + 7 0 - 14 0 GACGG
271 chr11 7729 7731 0.19 21 4 B G + 7 1 - 14 3 CTCGA
272 chr11 7748 7750 0.0435 23 1 B G + 8 0 - 15 1 ACCGA
273 chr11 7825 7827 0.05 20 1 B G + 11 0 - 9 1 GACGC
274 chr11 7866 7868 0.0455 22 1 B G + 12 0 - 10 1 CCCGA
275 chr11 7878 7880 0.0952 21 2 B G + 13 1 - 8 1 CCCGT
276 chr11 7882 7884 0.3 20 6 B G + 12 5 - 8 1 TACGA
277 chr11 8027 8029 0.167 18 3 B G + 13 2 - 5 1 AACGG
278 chr11 8033 8035 0.0625 16 1 B G + 11 1 - 5 0 ACCGT
279 chr11 8303 8305 0.0435 23 1 B G + 10 0 - 13 1 ACCGA
280 chr11 8414 8416 0.444 27 12 B G + 11 4 - 16 8 CCCGG
281 chr11 8583 8585 0.148 27 4 B G + 11 1 - 16 3 CACGC
282 chr11 8678 8680 0 17 0 B G + 8 0 - 9 0 CTCGT
283 chr11 8692 8694 0.0526 19 1 B G + 8 0 - 11 1 TTCGA
284 chr11 8755 8757 0.0417 24 1 B G + 3 0 - 21 1 CTCGC
285 chr11 8786 8788 0 19 0 B G + 1 0 - 18 0 AACGT
286 chr11 8812 8814 0 21 0 B G + 4 0 - 17 0 CCCGG
287 chr11 8829 8831 0.136 22 3 B G + 5 0 - 17 3 ATCGA
288 chr11 8836 8838 0.0476 21 1 B G + 4 0 - 17 1 CCCGG
289 chr11 8855 8857 0.0909 22 2 B G + 6 1 - 16 1 ACCGG
290 chr11 8902 8904 0.333 15 5 B G + 4 0 - 11 5 CCCGA
291 chr11 8914 8916 0.308 13 4 B G + 3 2 - 10 2 TACGG
292 chr11 8920 8922 0 12 0 B G + 4 0 - 8 0 CTCGC
293 chr11 8948 8950 0.0588 17 1 B G + 4 0 - 13 1 AACGA
294 chr11 8975 8977 0 19 0 B G + 4 0 - 15 0 GTCGC
295 chr11 9127 9129 0.0968 31 3 B G + 13 1 - 18 2 CTCGG
296 chr11 9136 9138 0.0606 33 2 B G + 15 1 - 18 1 CCCGC
297 chr11 9227 9229 0.0526 38 2 B G + 17 2 - 21 0 CACGC
298 chr11 9270 9272 0.0909 33 3 B G + 16 2 - 17 1 ACCGC
299 chr11 9301 9303 0.0303 33 1 B G + 15 1 - 18 0 CTCGC
300 chr11 9371 9373 0 32 0 B G + 21 0 - 11 0 TTCGA
301 chr11 9380 9382 0 31 0 B G + 22 0 - 9 0 AACGT
302 chr11 9447 9449 0 30 0 B G + 25 0 - 5 0 CACGT
303 chr11 9478 9480 0.0476 21 1 B G + 15 0 - 6 1 ATCGC
304 chr11 9510 9512 0.0435 23 1 B G + 14 1 - 9 0 CTCGA
305 chr11 9588 9590 0.111 18 2 B G + 11 1 - 7 1 GGCGC
306 chr11 9677 9679 0.231 13 3 + G + 13 3 - 0 0 ATCGA
307 chr11 9697 9699 0.2 15 3 B G + 14 3 - 1 0 TCCGA
308 chr11 9709 9711 0.111 18 2 B G + 16 2 - 2 0 GCCGG
309 chr11 9729 9731 0 16 0 B G + 14 0 - 2 0 GACGA
310 chr11 9799 9801 0 7 0 B G + 4 0 - 3 0 TTCGG