|
[up]
|
|
drwxr-xr-x |
 output_dedup_max_mismatch0_sorted.pairsam
|
372798 |
-rw-r--r-- |
|
output_dedup_max_mismatch0_sorted.stats
|
13343 |
-rw-r--r-- |
|
output_dedup_max_parent_id_bytile_sorted.pairsam
|
372678 |
-rw-r--r-- |
|
output_dedup_max_parent_id_bytile_sorted.stats
|
13420 |
-rw-r--r-- |
|
output_dedup_max_parent_id_bytile_sorted_tile_dups.stats
|
151 |
-rw-r--r-- |
|
output_dedup_pairs.pairsam
|
372026 |
-rw-r--r-- |
|
output_dedup_pairs.stats
|
13341 |
-rw-r--r-- |
|
output_dedup_pairs_markdups.pairsam
|
372542 |
-rw-r--r-- |
|
output_dedup_pairs_markdups.pairsam.gz
|
101201 |
-rw-r--r-- |
|
output_dedup_sorted.pairsam
|
373866 |
-rw-r--r-- |
|
output_dups_pairs_markdups.pairsam
|
10523 |
-rw-r--r-- |
|
output_pairs_split.bam
|
92148 |
-rw-r--r-- |
|
output_pairs_split.pairs
|
63571 |
-rw-r--r-- |
|
output_parsed_pairs.stats
|
10895 |
-rw-r--r-- |
|
output_parsed_pairs_bam.pairs
|
876390 |
-rw-r--r-- |
|
output_parsed_pairs_bam_5unique.pairs
|
876160 |
-rw-r--r-- |
|
output_parsed_pairs_bam_min_mapq_40.pairs
|
876148 |
-rw-r--r-- |
|
output_parsed_pairs_bam_readid_dropped.pairs
|
802643 |
-rw-r--r-- |
|
output_parsed_pairs_bam_readid_dropped_seq.pairs
|
231910 |
-rw-r--r-- |
|
output_parsed_pairs_sam.pairs
|
583430 |
-rw-r--r-- |
|
output_parsed_pairs_sam.pairs.gz
|
114431 |
-rw-r--r-- |
|
output_parsed_pairs_sam_assemblyname.pairs
|
583462 |
-rw-r--r-- |
|
output_parsed_pairs_sam_assemblyname.pairs.gz
|
114395 |
-rw-r--r-- |
|
output_parsed_pairs_sam_mapq.pairs
|
740947 |
-rw-r--r-- |
|
output_sorted_pairs.pairs
|
877743 |
-rw-r--r-- |
|
output_sorted_pairs.pairsam
|
876417 |
-rw-r--r-- |
|
output_sorted_pairs.pairsam.gz
|
192747 |
-rw-r--r-- |
|
pairs_output.stats
|
10916 |
-rw-r--r-- |
|
pairs_output2.stats
|
4824 |
-rw-r--r-- |
|
pairs_output2.stats.gz
|
931 |
-rw-r--r-- |
|
pairs_output_merged.stats
|
10930 |
-rw-r--r-- |
|
pairs_output_with_chromsize.stats
|
10916 |
-rw-r--r-- |
|
pairs_output_yaml.stats
|
6422 |
-rw-r--r-- |
|
test.bam
|
176282 |
-rw-r--r-- |
|
test.genome
|
16 |
-rw-r--r-- |
|
test.reduced.chrom.sizes
|
229 |
-rw-r--r-- |
|
test.sam
|
528028 |
-rw-r--r-- |
