comparison test-data/contigs.fa @ 8:ad80238462c1 draft

planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/shovill commit 1e28eb4ffcf3d9168877c291d27e533b96021445
author iuc
date Fri, 16 Sep 2022 14:39:43 +0000
parents d9f6a00b6db7
children
comparison
equal deleted inserted replaced
7:2a9baa0c4316 8:ad80238462c1
1 >contig00001 len=14151 cov=4.0 corr=0 spades=NODE_1_length_14151_cov_3.95289_pilon 1 >contig00001 len=1129 cov=61.4 corr=0 origname=Contig_1_61.3517 sw=shovill-skesa/1.1.0 date=20220816
2 GAAGAAGTAAAAAAGGGCTATTTTCCAATCAAACGTGCGATTGACTTGGTATTAAGTATC 2 TAGAAATTTTTTAGCTGGTTTAACACCCTCTGTAAAAGCCCATCCATGCGCAGTAAAAAC
3 GTTTTATTATTTTTAACATTTCCGATTATGTTCATATTCGCCATTGCTATCGTCATAGAT 3 TACACGTGTGTCTTTCGATTTCGAAATGAACTTCGCAATTCGTCCGACCGTTCCAGCTTT
4 TCGCCAGGAAACCCTATTTATAGTCAGGTTAGAGTTGGGAAGATGGGTAAATTAATTAAA 4 GGAAGAATGTAGATGGATAACATCAGGTTTAATTTTCGAGAATAACTGTGCTAACACTTT
5 ATATACAAATTACGTTCGATGTGTAAAAACGCAGAGAAAAACGGTGCGCAATGGGCTGAT 5 GACAGCTAAAATATCTTGTTTAAAGTCAATTGGACCTACTAAATGTTCGATAATAATTAC
6 AAAGATGATGATCGTATAACAAATGTCGGGAAGTTTATTCGTAAAACACGCATTGATGAA 6 ATTGACTCTTGCATCTAGTTGTTCAATCATTGGTCCATGATTGCCTACAATGACATAAAC
7 TTACCACAACTAATTAATGTTGTTAAAGGGGAAATGAGTTTTATTGGACCACGCCCGGAA 7 ATCATGGTGTACGCAAAAATGGTTAGCGAGTTGAATGAGATGTGTTTGTGCACCACCATT
8 CGTCCAGAATTTGTAGAATTATTTAGTTCAGAAATAATAGGATTTGAGCAAAGATGTCTT 8 ATCTGCTTTAGTAATACAATATATAATTTTCAACTGTTACAAACCCCTTTAATGCTATAC
9 GTTACACCAGGATTAACAGGTCTTGCGCAAATTCAAGGTGGATATGACTTAACACCACAA 9 TTTCAATTTCTTAACATGGCTATCTCATCAGATGAATAGTATTTATAGCCATGCAAATCA
10 CAAAAATTAAAATATGACATGAAATATATACATAAAGGTAGCTTAATGATGGAATTATAT 10 ATGATGGCAAATATTTCTTAATGCCATTTGATACTGTCTCAAGGGATTCCTCGTTATACT
11 ATATCAATTAGAACATTGATGGTTGTTATTACAGGGGAAGGCTCAAGGTAGTCTTAATTT 11 GTAACAATTGGTCACAATCTTTAAAATGTAACTTTTATTTAAACTTATTAAGCAAATTAA
12 GCTTAATAAGTTTAAATAAAAGTTACATTTTAAAGATTGTGACCAATTGTTACAGTATAA 12 GACTACCTTGAGCCTTCCCCTGTAATAACAACCATCAATGTTCTAATTGATATATATAAT
13 CGAGGAATCCCTTGAGACAGTATCAAATGGCATTAAGAAATATTTGCCATCATTGATTTG 13 TCCATCATTAAGCTACCTTTATGTATATATTTCATGTCATATTTTAATTTTTGTTGTGGT
14 CATGGCTATAAATACTATTCATCTGATGAGATAGCCATGTTAAGAAATTGAAAGTATAGC 14 GTTAAGTCATATCCACCTTGAATTTGCGCAAGACCTGTTAATCCTGGTGTAACAAGACAT
15 ATTAAAGGGGTTTGTAACAGTTGAAAATTATATATTGTATTACTAAAGCAGATAATGGTG 15 CTTTGCTCAAATCCTATTATTTCTGAACTAAATAATTCTACAAATTCTGGACGTTCCGGG
16 GTGCACAAACACATCTCATTCAACTCGCTAACCATTTTTGCGTACACCATGATGTTTATG 16 CGTGGTCCAATAAAACTCATTTCCCCTTTAACAACATTAATTAGTTGTGGTAATTCATCA
17 TCATTGTAGGCAATCATGGACCAATGATTGAACAACTAGATGCAAGAGTCAATGTAATTA 17 ATGCGTGTTTTACGAATAAACTTCCCGACATTTGTTATACGATCATCATCTTTATCAGCC
18 TTATCGAACATTTAGTAGGTCCAATTGACTTTAAACAAGATATTTTAGCTGTCAAAGTGT 18 CATTGCGCACCGTTTTTCTCTGCGTTTTTACACATCGAACGTAATTTGTATATTTTAATT
19 TAGCACAGTTATTCTCGAAAATTAAACCTGATGTTATCCATCTACATTCTTCCAAAGCTG 19 AATTTACCCATCTTCCCAACTCTAACCTGACTATAAATAGGGTTTCCTGGCGAATCTATG
20 GAACGGTCGGACGAATTGCGAAGTTCATTTCGAAATCGAAAGACACACGTGTAGTTTTTA 20 ACGATAGCAATGGCGAATATGAACATAATCGGAAATGTTAAAAATAATA
21 CTGCGCATGGATGGGCTTTTACAGAGGGTGTTAAACCAGCTAAAAAATTTCTATATCTAG
22 TTATTGAAAAATTAATGTCACGTATTACAGATAGCATTATTTGTGTTTCAGATTTCGATA