diff test-data/contigs.fa @ 8:ad80238462c1 draft

planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/shovill commit 1e28eb4ffcf3d9168877c291d27e533b96021445
author iuc
date Fri, 16 Sep 2022 14:39:43 +0000
parents d9f6a00b6db7
children
line wrap: on
line diff
--- a/test-data/contigs.fa	Thu Feb 03 20:41:04 2022 +0000
+++ b/test-data/contigs.fa	Fri Sep 16 14:39:43 2022 +0000
@@ -1,22 +1,20 @@
->contig00001 len=14151 cov=4.0 corr=0 spades=NODE_1_length_14151_cov_3.95289_pilon
-GAAGAAGTAAAAAAGGGCTATTTTCCAATCAAACGTGCGATTGACTTGGTATTAAGTATC
-GTTTTATTATTTTTAACATTTCCGATTATGTTCATATTCGCCATTGCTATCGTCATAGAT
-TCGCCAGGAAACCCTATTTATAGTCAGGTTAGAGTTGGGAAGATGGGTAAATTAATTAAA
-ATATACAAATTACGTTCGATGTGTAAAAACGCAGAGAAAAACGGTGCGCAATGGGCTGAT
-AAAGATGATGATCGTATAACAAATGTCGGGAAGTTTATTCGTAAAACACGCATTGATGAA
-TTACCACAACTAATTAATGTTGTTAAAGGGGAAATGAGTTTTATTGGACCACGCCCGGAA
-CGTCCAGAATTTGTAGAATTATTTAGTTCAGAAATAATAGGATTTGAGCAAAGATGTCTT
-GTTACACCAGGATTAACAGGTCTTGCGCAAATTCAAGGTGGATATGACTTAACACCACAA
-CAAAAATTAAAATATGACATGAAATATATACATAAAGGTAGCTTAATGATGGAATTATAT
-ATATCAATTAGAACATTGATGGTTGTTATTACAGGGGAAGGCTCAAGGTAGTCTTAATTT
-GCTTAATAAGTTTAAATAAAAGTTACATTTTAAAGATTGTGACCAATTGTTACAGTATAA
-CGAGGAATCCCTTGAGACAGTATCAAATGGCATTAAGAAATATTTGCCATCATTGATTTG
-CATGGCTATAAATACTATTCATCTGATGAGATAGCCATGTTAAGAAATTGAAAGTATAGC
-ATTAAAGGGGTTTGTAACAGTTGAAAATTATATATTGTATTACTAAAGCAGATAATGGTG
-GTGCACAAACACATCTCATTCAACTCGCTAACCATTTTTGCGTACACCATGATGTTTATG
-TCATTGTAGGCAATCATGGACCAATGATTGAACAACTAGATGCAAGAGTCAATGTAATTA
-TTATCGAACATTTAGTAGGTCCAATTGACTTTAAACAAGATATTTTAGCTGTCAAAGTGT
-TAGCACAGTTATTCTCGAAAATTAAACCTGATGTTATCCATCTACATTCTTCCAAAGCTG
-GAACGGTCGGACGAATTGCGAAGTTCATTTCGAAATCGAAAGACACACGTGTAGTTTTTA
-CTGCGCATGGATGGGCTTTTACAGAGGGTGTTAAACCAGCTAAAAAATTTCTATATCTAG
-TTATTGAAAAATTAATGTCACGTATTACAGATAGCATTATTTGTGTTTCAGATTTCGATA
+>contig00001 len=1129 cov=61.4 corr=0 origname=Contig_1_61.3517 sw=shovill-skesa/1.1.0 date=20220816
+TAGAAATTTTTTAGCTGGTTTAACACCCTCTGTAAAAGCCCATCCATGCGCAGTAAAAAC
+TACACGTGTGTCTTTCGATTTCGAAATGAACTTCGCAATTCGTCCGACCGTTCCAGCTTT
+GGAAGAATGTAGATGGATAACATCAGGTTTAATTTTCGAGAATAACTGTGCTAACACTTT
+GACAGCTAAAATATCTTGTTTAAAGTCAATTGGACCTACTAAATGTTCGATAATAATTAC
+ATTGACTCTTGCATCTAGTTGTTCAATCATTGGTCCATGATTGCCTACAATGACATAAAC
+ATCATGGTGTACGCAAAAATGGTTAGCGAGTTGAATGAGATGTGTTTGTGCACCACCATT
+ATCTGCTTTAGTAATACAATATATAATTTTCAACTGTTACAAACCCCTTTAATGCTATAC
+TTTCAATTTCTTAACATGGCTATCTCATCAGATGAATAGTATTTATAGCCATGCAAATCA
+ATGATGGCAAATATTTCTTAATGCCATTTGATACTGTCTCAAGGGATTCCTCGTTATACT
+GTAACAATTGGTCACAATCTTTAAAATGTAACTTTTATTTAAACTTATTAAGCAAATTAA
+GACTACCTTGAGCCTTCCCCTGTAATAACAACCATCAATGTTCTAATTGATATATATAAT
+TCCATCATTAAGCTACCTTTATGTATATATTTCATGTCATATTTTAATTTTTGTTGTGGT
+GTTAAGTCATATCCACCTTGAATTTGCGCAAGACCTGTTAATCCTGGTGTAACAAGACAT
+CTTTGCTCAAATCCTATTATTTCTGAACTAAATAATTCTACAAATTCTGGACGTTCCGGG
+CGTGGTCCAATAAAACTCATTTCCCCTTTAACAACATTAATTAGTTGTGGTAATTCATCA
+ATGCGTGTTTTACGAATAAACTTCCCGACATTTGTTATACGATCATCATCTTTATCAGCC
+CATTGCGCACCGTTTTTCTCTGCGTTTTTACACATCGAACGTAATTTGTATATTTTAATT
+AATTTACCCATCTTCCCAACTCTAACCTGACTATAAATAGGGTTTCCTGGCGAATCTATG
+ACGATAGCAATGGCGAATATGAACATAATCGGAAATGTTAAAAATAATA