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comparison rnaseq/cutadapt/test-data/1.lav @ 11:a712b378e090

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cutadapt added
author jjkoehorst <jasperkoehorst@gmail.com>
date Sat, 21 Feb 2015 16:33:42 +0100
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
10:3378d12591ea 11:a712b378e090
1 #:lav
2 d {
3 "blastz out.seq1m seq2data Y=3400 H=0 W=8 B=2 K=3000 C=0 m=83886080 P=0
4 A C G T
5 91 -114 -31 -123
6 -114 100 -125 -31
7 -31 -125 100 -114
8 -123 -31 -114 91
9 O = 400, E = 30, K = 3000, L = 3000, M = 50"
10 }
11 #:lav
12 s {
13 "out.seq1m" 1 1680 0 1
14 "seq2data" 1 1680 0 1
15 }
16 h {
17 ">seqmask seq1data out.repeats"
18 ">seq2"
19 }
20 a {
21 s 161304
22 b 1 1
23 e 1680 1680
24 l 1 1 1680 1680 100
25 }
26 a {
27 s 15173
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29 e 450 505
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37 l 426 481 450 505 96
38 }
39 a {
40 s 12134
41 b 191 343
42 e 361 503
43 l 191 343 215 367 80
44 l 216 369 244 397 86
45 l 256 398 361 503 95
46 }
47 a {
48 s 4422
49 b 192 431
50 e 276 505
51 l 192 431 212 451 100
52 l 223 452 244 473 95
53 l 247 474 254 481 63
54 l 255 484 276 505 91
55 }
56 a {
57 s 6872
58 b 192 311
59 e 330 450
60 l 192 311 215 334 83
61 l 216 336 275 395 73
62 l 286 396 307 417 91
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64 }
65 a {
66 s 14437
67 b 192 224
68 e 472 505
69 l 192 224 223 255 84
70 l 224 257 255 288 84
71 l 257 289 277 309 90
72 l 288 310 308 330 90
73 l 309 342 362 395 85
74 l 374 396 395 417 91
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76 l 428 450 449 471 95
77 l 450 483 472 505 91
78 }
79 a {
80 s 7306
81 b 192 399
82 e 308 505
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87 }
88 a {
89 s 11180
90 b 193 290
91 e 396 505
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98 }
99 a {
100 s 14437
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112 }
113 a {
114 s 15173
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125 }
126 a {
127 s 11180
128 b 290 193
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136 }
137 a {
138 s 6872
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145 }
146 a {
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154 a {
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162 }
163 a {
164 s 4422
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171 }
172 x {
173 n 0
174 }
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176 n 0
177 }
178 #:eof