view rnaseq/cutadapt/test-data/1.lav @ 11:a712b378e090

cutadapt added
author jjkoehorst <jasperkoehorst@gmail.com>
date Sat, 21 Feb 2015 16:33:42 +0100
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#:lav
d {
  "blastz out.seq1m seq2data Y=3400 H=0 W=8 B=2 K=3000 C=0 m=83886080 P=0
     A    C    G    T
    91 -114  -31 -123
  -114  100 -125  -31
   -31 -125  100 -114
  -123  -31 -114   91
  O = 400, E = 30, K = 3000, L = 3000, M = 50"
}
#:lav
s {
  "out.seq1m" 1 1680 0 1
  "seq2data" 1 1680 0 1
}
h {
   ">seqmask seq1data out.repeats"
   ">seq2"
}
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  s 161304
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a {
  s 15173
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}
a {
  s 12134
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  e 361 503
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  l 216 369 244 397 86
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a {
  s 4422
  b 192 431
  e 276 505
  l 192 431 212 451 100
  l 223 452 244 473 95
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}
a {
  s 6872
  b 192 311
  e 330 450
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  l 216 336 275 395 73
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}
a {
  s 14437
  b 192 224
  e 472 505
  l 192 224 223 255 84
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  l 428 450 449 471 95
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}
a {
  s 7306
  b 192 399
  e 308 505
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}
a {
  s 11180
  b 193 290
  e 396 505
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}
a {
  s 14437
  b 224 192
  e 505 472
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a {
  s 15173
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a {
  s 11180
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a {
  s 6872
  b 311 192
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}
a {
  s 12134
  b 343 191
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}
a {
  s 7306
  b 399 192
  e 505 308
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}
a {
  s 4422
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}
x {
  n 0
}
m {
  n 0
}
#:eof