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comparison metaMS/INFO_structure_of_LC.txt @ 6:4393f982d18f

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author pieter.lukasse@wur.nl
date Thu, 19 Mar 2015 12:22:23 +0100
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16 $ xset :Formal class 'xsAnnotate' [package "CAMERA"] with 15 slots
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21
22 and groups() function:
23 "mzmed", "mzmin", "mzmax", "rtmed", "rtmin", "rtmax", "npeaks", "CLASS1", "CLASS2"
24
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293 From http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/manuals/xcms/man/xcms.pdf:
294
295 mz weighted (by intensity) mean of peak m/z across scans
296 mzmin m/z of minimum step
297 mzmax m/z of maximum step
298 rt retention time of peak midpoint
299 rtmin leading edge of peak retention time
300 rtmax trailing edge of peak retention time
301 into integrated area of original (raw) peak
302 intf integrated area of filtered peak
303 maxo maximum intensity of original (raw) peak
304 maxf maximum intensity of filtered peak
305 i rank of peak identified in merged EIC (<= max)
306 sn signal to noise ratio of the peak
307
308 .. .. .. ..@ groups : num [1:1828, 1:9] 30.2 30.5 31.4 32.4 33.4 ...
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