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diff metaMS/INFO_structure_of_LC.txt @ 6:4393f982d18f
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[list output truncated] + .. ..@ derivativeIons : list() + .. ..@ formula : list() + .. ..@ sample : num NA + .. ..@ xcmsSet :Formal class 'xcmsSet' [package "xcms"] with 12 slots + .. .. .. ..@ peaks : num [1:9826, 1:13] 30.2 30.5 31.4 32.4 33.3 ... + .. .. .. .. ..- attr(*, "dimnames")=List of 2 + .. .. .. .. .. ..$ : NULL + .. .. .. .. .. ..$ : chr [1:13] "mz", "mzmin", "mzmax", "rt", "rtmin", "rtmax", "into", "intf", "maxo", "maxf", "i", "sn", "sample" (found with dput) + From http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/manuals/xcms/man/xcms.pdf: + + mz weighted (by intensity) mean of peak m/z across scans +mzmin m/z of minimum step +mzmax m/z of maximum step +rt retention time of peak midpoint +rtmin leading edge of peak retention time +rtmax trailing edge of peak retention time +into integrated area of original (raw) peak +intf integrated area of filtered peak +maxo maximum intensity of original (raw) peak +maxf maximum intensity of filtered peak +i rank of peak identified 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