comparison Roary/t/data/core_alignment_gene_lookup/expected_core_gene_alignment.aln @ 0:c47a5f61bc9f draft

Uploaded
author dereeper
date Fri, 14 May 2021 20:27:06 +0000
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:c47a5f61bc9f
1 >query_1
2 ATGAATCTACCTTTACCTGATAATTATGAATTTGTGTTTTTATCTGGTGGATTATCTGGG
3 CATGCTGCAATGATGTCATTTTTTAATGTTTGTGGCATTGGATATTTGTATCATCATATG
4 GATTTAATGAAAAATAGATATATAGATTATTACCATTTTTCTAGGATTGAAAATTTATAT
5 TCAATTATAACATATGGACAATACAGTTTAACGCAAGGAATGAATAATATAGGTAAATAT
6 TTGACTTTAATTAATAAAATTCCAATTCTTTTTTTGGTAAGAGATCCCATATCAAGACTA
7 AAAACCGGAGTAAATCATCCTATTCTAAATCCAAAAAGTATGAAGGAGATATGTTTAAAC
8 AATGATTATAGTGATGTGTTTAAGAATAAAATGTATGTTGGCGATATTGGAAAAAATTTT
9 TACTATTCAGAAAAGCCAAGCATGAAATATTTACCTAGATTGAAATATGAAAATTTGGGA
10 ATATTTTTAAAACCACAAGAATTTGAGCGTTTAAAGCAAGATTCTAAGCTATTTGATGTT
11 GCTAAAAGATATTTGAATAATTTTATTGAAGCTTTAGAAGAGAGAATAGACCTAGAAAAA
12 GCTAAATTATTTAAAGAAAAAGACGTGTTAAACTATTTAAAAGAAAATAAAGAATTAAGA
13 GTTAAGTTAAAAAACATATTAGATAAAGAACTTGTTCATATTAAACAACATCGTCCAGAT
14 ATAGTAGCTTCTTGGAAATACTATCAAGAATTTGAACAAATGTGCAAGGAGTTGAATGGT
15 AATATTTAG
16 >query_2
17 ATGAATCTACCTTTACCTGATAATTATGAATTTGTGTTTTTATCTGGTGGATTATCTGGG
18 CATGCTGCAATGATGTCATTTTTTAATGTTTGTGGCATTGGATATTTGTATCATCATATG
19 GATTTAATGAAAAATAGATATATAGATTATTACCATTTTTCTAGGATTGAAAATTTATAT
20 TCAATTATAACATATGGACAATACAGTTTAACGCAAGGAATGAATAATATAGGTAAATAT
21 TTGACTTTAATTAATNNNNNNNNNATTCTTTTTTTGGTAAGAGATCCCATATCAAGACTA
22 AAAACCGGAGTAAATCATCCTATTCTAAATCCAAAAAGTATGAAGGAGATATGTTTAAAC
23 AATGATTATAGTGATNNNNNNNNNAATAAAATGTATGTTGGCGATATTGGAAAAAATTTT
24 TACTATTCAGAAAAGCCAAGCATGAAATATTTACCTAGATTGAAATATGAAAATTTGGGA
25 ATATTTTTAAAACCACAAGAATTTGAGCGTTTAAAGCAAGATTCTAAGCTATTTGATGTT
26 GCTAAAAGATATTTGAATAATTTTATTGAAGCTTTAGAAGAGAGAATAGACCTAGAAAAA
27 GCTAAATTATTTAAAGAAAAAGACGTGTTAAACTATTTAAAAGAAAATAAAGAATTAAGA
28 GTTAAGTTAAAAAACATATTAGATAAAGAACTTGTTCATATTAAACAACATCGTCCAGAT
29 ATAGTAGCTTCTTGGAAATACTATCAAGAATTTGAACAAATGTGCAAGGAGTTGAATGGT
30 AATATTTAG
31 >query_3
32 ATGAATCTACCTTTACCTGATAATTATGAATTTGTGTTTTTATCTGGTGGATTATCTGGG
33 CATGCTGCAATGATGTCATTTTTTAATGTTTGTGGCATTGGATATTTGTATCATCATATG
34 GATTTAATGAAAAATAGATATATAGATTATTACCATTTTTCTAGGATTGAAAATTTATAT
35 TCAATTATAACATATGGACAATACAGTTTAACGCAAGGAATGAATAATATAGGTAAATAT
36 TTGACTTTAATTAATAAAATTCCAATTCTTTTTTTGGTAAGAGATCCCATATCAAGACTA
37 AAAACCGGAGTAAATCATCCTATTCTAAATCCAAAAAGTATGAAGGAGATATGTTTAAAC
38 AATGATTATAGTGATGTGTTTAAGAATAAAATGTATGTTGGCGATATTGGAAAAAATTTT
39 TACTATTCAGAAAAGCCAAGCATGAAATATTTACCTAGATTGAAATATGAAAATTTGGGA
40 ATATTTTTAAAACCACAAGAATTCGAGCGTTTAAAGCAAGATTCTAAGCTATTTGATGTT
41 GCTAAAAGATATTTGAATAATTTTATTGAAGCTTTAGAAGAGAGAATAGACCTAGAAAAA
42 GCTAAATTATTTAAAGAAAAAGACGTGTTAAACTATTTAAAAGAAAATAAAGAATTAAGA
43 GTTAAGTTAAAAAACATATTAGATAAAGAACTTGTTCATATTAAACAACATCGTCCAGAT
44 ATAGTAGCTTCTTGGAAATACTATCAAGAATTTGAACAAATGTGCAAGGAGTTGAATGGT
45 AATATTTAG