Mercurial > repos > dereeper > roary_plots

diff Roary/t/data/core_alignment_gene_lookup/expected_core_gene_alignment.aln @ 0:c47a5f61bc9f draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Uploaded
author dereeper
date Fri, 14 May 2021 20:27:06 +0000
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/Roary/t/data/core_alignment_gene_lookup/expected_core_gene_alignment.aln	Fri May 14 20:27:06 2021 +0000
@@ -0,0 +1,45 @@
+>query_1
+ATGAATCTACCTTTACCTGATAATTATGAATTTGTGTTTTTATCTGGTGGATTATCTGGG
+CATGCTGCAATGATGTCATTTTTTAATGTTTGTGGCATTGGATATTTGTATCATCATATG
+GATTTAATGAAAAATAGATATATAGATTATTACCATTTTTCTAGGATTGAAAATTTATAT
+TCAATTATAACATATGGACAATACAGTTTAACGCAAGGAATGAATAATATAGGTAAATAT
+TTGACTTTAATTAATAAAATTCCAATTCTTTTTTTGGTAAGAGATCCCATATCAAGACTA
+AAAACCGGAGTAAATCATCCTATTCTAAATCCAAAAAGTATGAAGGAGATATGTTTAAAC
+AATGATTATAGTGATGTGTTTAAGAATAAAATGTATGTTGGCGATATTGGAAAAAATTTT
+TACTATTCAGAAAAGCCAAGCATGAAATATTTACCTAGATTGAAATATGAAAATTTGGGA
+ATATTTTTAAAACCACAAGAATTTGAGCGTTTAAAGCAAGATTCTAAGCTATTTGATGTT
+GCTAAAAGATATTTGAATAATTTTATTGAAGCTTTAGAAGAGAGAATAGACCTAGAAAAA
+GCTAAATTATTTAAAGAAAAAGACGTGTTAAACTATTTAAAAGAAAATAAAGAATTAAGA
+GTTAAGTTAAAAAACATATTAGATAAAGAACTTGTTCATATTAAACAACATCGTCCAGAT
+ATAGTAGCTTCTTGGAAATACTATCAAGAATTTGAACAAATGTGCAAGGAGTTGAATGGT
+AATATTTAG
+>query_2
+ATGAATCTACCTTTACCTGATAATTATGAATTTGTGTTTTTATCTGGTGGATTATCTGGG
+CATGCTGCAATGATGTCATTTTTTAATGTTTGTGGCATTGGATATTTGTATCATCATATG
+GATTTAATGAAAAATAGATATATAGATTATTACCATTTTTCTAGGATTGAAAATTTATAT
+TCAATTATAACATATGGACAATACAGTTTAACGCAAGGAATGAATAATATAGGTAAATAT
+TTGACTTTAATTAATNNNNNNNNNATTCTTTTTTTGGTAAGAGATCCCATATCAAGACTA
+AAAACCGGAGTAAATCATCCTATTCTAAATCCAAAAAGTATGAAGGAGATATGTTTAAAC
+AATGATTATAGTGATNNNNNNNNNAATAAAATGTATGTTGGCGATATTGGAAAAAATTTT
+TACTATTCAGAAAAGCCAAGCATGAAATATTTACCTAGATTGAAATATGAAAATTTGGGA
+ATATTTTTAAAACCACAAGAATTTGAGCGTTTAAAGCAAGATTCTAAGCTATTTGATGTT
+GCTAAAAGATATTTGAATAATTTTATTGAAGCTTTAGAAGAGAGAATAGACCTAGAAAAA
+GCTAAATTATTTAAAGAAAAAGACGTGTTAAACTATTTAAAAGAAAATAAAGAATTAAGA
+GTTAAGTTAAAAAACATATTAGATAAAGAACTTGTTCATATTAAACAACATCGTCCAGAT
+ATAGTAGCTTCTTGGAAATACTATCAAGAATTTGAACAAATGTGCAAGGAGTTGAATGGT
+AATATTTAG
+>query_3
+ATGAATCTACCTTTACCTGATAATTATGAATTTGTGTTTTTATCTGGTGGATTATCTGGG
+CATGCTGCAATGATGTCATTTTTTAATGTTTGTGGCATTGGATATTTGTATCATCATATG
+GATTTAATGAAAAATAGATATATAGATTATTACCATTTTTCTAGGATTGAAAATTTATAT
+TCAATTATAACATATGGACAATACAGTTTAACGCAAGGAATGAATAATATAGGTAAATAT
+TTGACTTTAATTAATAAAATTCCAATTCTTTTTTTGGTAAGAGATCCCATATCAAGACTA
+AAAACCGGAGTAAATCATCCTATTCTAAATCCAAAAAGTATGAAGGAGATATGTTTAAAC
+AATGATTATAGTGATGTGTTTAAGAATAAAATGTATGTTGGCGATATTGGAAAAAATTTT
+TACTATTCAGAAAAGCCAAGCATGAAATATTTACCTAGATTGAAATATGAAAATTTGGGA
+ATATTTTTAAAACCACAAGAATTCGAGCGTTTAAAGCAAGATTCTAAGCTATTTGATGTT
+GCTAAAAGATATTTGAATAATTTTATTGAAGCTTTAGAAGAGAGAATAGACCTAGAAAAA
+GCTAAATTATTTAAAGAAAAAGACGTGTTAAACTATTTAAAAGAAAATAAAGAATTAAGA
+GTTAAGTTAAAAAACATATTAGATAAAGAACTTGTTCATATTAAACAACATCGTCCAGAT
+ATAGTAGCTTCTTGGAAATACTATCAAGAATTTGAACAAATGTGCAAGGAGTTGAATGGT
+AATATTTAG