Mercurial > repos > rnateam > mirdeep2_mapper
view test-data/cel_cluster.fa @ 0:af18bb0baa92 draft
Imported from capsule None
author | rnateam |
---|---|
date | Tue, 27 Jan 2015 09:06:06 -0500 |
parents | |
children |
line wrap: on
line source
>chrII:11534525-11540624 tccaaaatattagaggccccacgaaaaggggagcagaacgaaaaggggat ctgcaaaaaggggatctgcgaaaaggggagatacgaaaaggggagatacg aaaaggggagcaacgaaaaggggatctggcactgtgccaaacgctatttt tctcaaagaaaacaatacaacgatgctccgatgttacgcgtcgcgtgttg ttaagcgtatcttctagaagaaaatttcaaaaatcaacgtgcgttgcgtg agaaaaattgcgttttgtgcgtttggcacagtgccagctccccttttcgt tgctccccttttcgtatctccccttttcgtatctccccttttcgcagatc ccctttttgcagatccccttttcgttctgctcccctcgtggggcctcaaa taatattgtcaatggagcgcagttgcgcacaccgaaatacgcacgaaatt tgaaattggcaggcctagaaagtctggatttaaaatatttatgcatatta acctgagtttcggcatgtttagataaatttagattaaaatttattaaata aaaatatttaaaatttattaaattcaacattatctttaattttacagaaa taaaaaccaaaaaaccaacgaagtgtaacttttcgacaataaatatttat aaattattcaattaattggaaatctatttatcacatctcatcgtgaacaa gcacatggctaaacaatgcctcgactttatccacccatcctggatttttc ctgttgaaaatcttcaaatccttcatagtctgctcaattgccttaacagc cttttcccttttcacatccttcgtcaattcctcaaccatcgcctctacaa gttgtgatcgtgaggccccttcaacgaatttcttgtccaatacatctctg agctgaaaaataagtccctttattcatgtgcaccacctgccactcattca ttttagatcctaatcctgtatttctctctctctctcactaatcgtcccgt catatctgacccactataatgaggggaccaccactttgccccagatttcg taatgagccaacatacactaggccctgttctagcacccccattgtgcatg ggagacacatcgtctgttggttcgggtcagctgagatgacgtggcagatg acgtcatgtttgttctctagcagatccctatcgtaaaataccgttctttg ttcgtttatgagcacttcttgggaaacaagaagaatattagagaatattg gattttaggaaatttcttgaccctaataatatgtatctcatggggctaat tacgaaagatttagagctcactaaagcagatgtggataagctggaactat agtcaattctcacgagatattattattagcttactcgttgaatttgatgc cgtgttaggtagaagccgagaacacgatgaaccttggaagttatgtagtc gagttttctggaagaaaaagtatatatagtttgataaaaagttacgtcat aagttattggtcccgagtgtgtacactagaaacttgcgcaatcagttggt caggtggtctaggacctttacatgtaatataattcattggtttgttgctc tagatctcaaagaatatggttttcctgctgagaaacaaaatttttttttc aaatgttcgcgatattatacgatttttttgcgctgaaaaatacggtatcc ggactcgacacgacagtttttcaataaattcggaaaggtacatatgcgcc tttgaagagtactgtaattttaaacatttgttgatgcagtaaatattctc acggatttttagaggtttttttttgaatatttatacagttatattagagt taaaaaaataaatctatttttatcgaaatttatgaaaaatctactcccca gaaacaaagtttgaatttacttaaaatgtatgtgcgcctttttaaattca acaaaaatttatcaaattttgtctttttaatcacttttacttttttttcg aaaaaaaaaaaaactttaaaaacaccgaaaattaaaatttttaattaccg taatcctttaaaggcgcacacctctttttcgcaatcataaaaatttacag gcacagaatttcctactgtaacgtgttttctcgatagaaacgtttctcca aatcgaaatttttattagcaatcatcaattcgtcatgtttctgtgctgga gcacattgttatgcagtgctcatgaatattcacagttgaaaatcgaattt ttttttcttatttttattaacttctctcctcactcaagtgcaatctcatt tcggcggaacgatgaaagcggactcgtttgaaacggattacactgctggc tggctccatcttttttatttctggtttttttcccgacacgggaggtcatc cgtccacgtcttcaatcttattcgcttctccttctatctatctctcttcc aaaaaaatggaacagattgtccgccttctactttccgcatgcgcctattc tagacatcgagaagaagcgagagaatccgaaaaactccgccgtccggcgc ctagcgttcatcccgtcgcatccaatttccttcacccctgtctccagtct ctaatctgtgtttcccagaccttctccttcttcttctcccctctttcttc cctttcttttctacgattcctagacctgcccggttgaccatcgggcccac catttatcgagcgcgtccgtctgttcgttgctgtgagcgcgcgcgcgcga gcgcacactgcacaccatttgaccgcaacgagccgagagagtgtgtgaaa tgaagagacgccgagtggacacgttgctctacaccaaacgcgctacacca aatgggcggagacccaatggtgcaccaagtcagcagtataaaaggaatgg aaatggtccattcagtcatcagttgtttttttattttctcttttctccca tcactttctcccttcttcccctctcctaatttccattcccaactattatt ctcggatcagatcgagccattgctggtttcttccacagtggtactttcca ttagaactatcaccgggtggaaactagcagtggctcgatcttttccactt gctccaccgctgtcggggaaccgcgccaattttcgcttcagtgctagacc atccaaagtgtctatcaccgggtgaaaattcgcatgggtccccgacgcgg aaagataaaatatcttaaaatcgattctagaaacccttggaccagtgtgg gtgtccgttgcggtgctacattctctaatctgtatcaccgggtgaacact tgcagtggtcctcgtggtttctctgtgagccaggtcctgttccggttttt tccgtggtgataacgcatccaaaagtctctatcaccgggagaaaaactgg agtaggacctgtgactcattccgatttctggagttttcccctacattcta ccattcagctactgattattgaattcctgatataccgagagcccagctga tttcgtcttggtaataagctcgtcattgagattatcaccgggtgtaaatc agcttggctctggtgtctccgaacctcctgtccgcacctcagtggatgta tgccatgatgataagatatcagaaatcctatcaccgggtgtacatcagct aaggtgcgggtacaggtgcatttgatatcaaggtgagttatttttaagtg ggtcccagagaccttggtggtttttctctgcagtgatagatacttctaac aactcgctatcaccgggtgaaaaatcacctaggtctggagcctcctgctc tttttttgctgtttttaaacttaaacttaaaactaacactttatcaaaat aaagtcttccaaaatcttttttctgatctgccggaagactttccatgaat ttgtccaaaactcgttgcactttatcctcgtcgtaatcatttgacaccat atctttggataactagaataattgaacattggtttaaaaaaattctctca aaaaaaaaatcacaaacctgatgaattttagcctcatctatagcagtatc tgcgagaagaatcgtaagattcattgataattctatatattttccaataa ttttatccgaagctggatgtgaagtttctacagtacctccgtggcataat actacaatggaagcaaaaagagcgacaattaggatcgtcattttagtgga gaatgatgaattgacccggctctttgggggttggaggattcattttcccc ttcaacaggtgctcaaataattaaagagaatagaaccgacgatatatggg tcaaatgtttatacagttgtgctactaaacgtattgttacacgcgttatt aataattagaattagaattatatcgttttgtacggattgagaatcccatt tgggtcgaaaatgttcttgagcttctttgtcaaaagtcgttcttcaggat cttttccgaatgtggagtacggtagcttcagttgaccgattccatgttca gctgaaattgacccgccgtgatcgacaacccattcgtagaggaagggata gagcctggaatttgaaattattaatagaattaaaattttataaaaaagaa aaatctcgaaacttacaatttttcaagttcttcattgtgtttttcagatg taatatttaaatgagtgtttccatctcccaaatgtccataagtgacaatt cttttagccaaagaaccacatcgttccttcatcacattcgtcaattcata ataattttccaatggtaaagaaacatcatgcttatagacatatccatctc tggtaaccgccaatggtgcactttctctcaattgccacatcttcgtagct tctgcagaagatccagcgagcactccgtcgataatcagattttttgagag gcattcatccaaaaatgcgctcattttctccatatcgtgatcttcattgg atcctgatgtttcgacaaggatcgagaatggggttggagcattcagtact gggtgcaatcctagattcgttttcaaacattccatcgtagcatcgtcgag aagttcgaaggaggaaaggatttcagtgaggctggattttgcaagcttca gtacttcgcagcattttttgaaggattcgatgcctgaaaaaaattagaaa ttgaaaaatttgaacccattatataaatattcaacctaccaagcatcgca ctttgtacacttttcggtttaggaaccgcagtcattgtgacgcttgtgat aacacccaactgcccttcacttcccaagaataggtgtggagtgtgcaaag ttgtgttgtccttccgaatgcttgatcccaaatgtagaacagttccatgt tcatcgggaagaaccaccgtgagcccgagaagatgtgcgtgaagacttcc gtatcgaatcaaccgaatccctcctgcacacgtggcaatatttcctccaa tctgacaggatcctttggctccgagatcaaaaggcatcatatatccgagt tttgcaagtttgttgtccaagtcttccagaataaaaccagaatcacactt gagaattcccattgtgtcgtcgaaagagaattgcttgttgattttattca ttgatataacaacttcatcatgtactggaattgatccaccaacgagtcct gtattccctccttgtgggactactgccaatttgttcttggagcaatacgc caatattgcagaaacctcttcggtgctcttcgggtagaggacgacactgc caggacctggaaattaaaacatttaatatttaaagtacctatttaatatt aaataaacctaatcttaaaatacaaatacctttaaattggcctgtccaat ctgtagtatgatttgtaatatcgtccttcttcactgcatcttgcccgaga aaattctcaaatgccattaaatccgactgcatcacttttgcaaatccttc atgtctggcggcaagaactgctgcgtagcttctagttggtcttctgattc gtggcaagattttcagaaacatctgaattcagaaacttttcaaaaaataa cttgaaacttcaaaagaaatagtaggagacaaagctcggctaggtgaccg >chrIII:2172325-2172669 CAGGCAGTCAGTCAGTCTCTCTCCACTCACATTCAGTCAGTCAGTGACCA TCACCAGGTTGTGTGTGAGCCCCTTCCATTATTCTTCTGAACCCCCCTCC CAACGCGGGAAGACTCGCCGGCAATGACACTGGTTATCTTTTCCATCGTG GAATGCCCCCCATTGATTTTTTCCCCTTTTCGGGGGGAAAAAATTGGAAA CGAGAAAGGTATCGGGTGTCATAGCCGGCGTGATCATCTTCCTCAAGTAT TCCTCTGCTGATTTCGATATTCGGAGGAGCTCGGAGGCTGTTCAGCTGTA AAATTGGTTGATTAAGCTCAAAAATCGGCGTTAACGCGGCTTTCC