view test-data/cel_cluster.fa @ 0:af18bb0baa92 draft

Imported from capsule None
author rnateam
date Tue, 27 Jan 2015 09:06:06 -0500
parents
children
line wrap: on
line source

>chrII:11534525-11540624
tccaaaatattagaggccccacgaaaaggggagcagaacgaaaaggggat
ctgcaaaaaggggatctgcgaaaaggggagatacgaaaaggggagatacg
aaaaggggagcaacgaaaaggggatctggcactgtgccaaacgctatttt
tctcaaagaaaacaatacaacgatgctccgatgttacgcgtcgcgtgttg
ttaagcgtatcttctagaagaaaatttcaaaaatcaacgtgcgttgcgtg
agaaaaattgcgttttgtgcgtttggcacagtgccagctccccttttcgt
tgctccccttttcgtatctccccttttcgtatctccccttttcgcagatc
ccctttttgcagatccccttttcgttctgctcccctcgtggggcctcaaa
taatattgtcaatggagcgcagttgcgcacaccgaaatacgcacgaaatt
tgaaattggcaggcctagaaagtctggatttaaaatatttatgcatatta
acctgagtttcggcatgtttagataaatttagattaaaatttattaaata
aaaatatttaaaatttattaaattcaacattatctttaattttacagaaa
taaaaaccaaaaaaccaacgaagtgtaacttttcgacaataaatatttat
aaattattcaattaattggaaatctatttatcacatctcatcgtgaacaa
gcacatggctaaacaatgcctcgactttatccacccatcctggatttttc
ctgttgaaaatcttcaaatccttcatagtctgctcaattgccttaacagc
cttttcccttttcacatccttcgtcaattcctcaaccatcgcctctacaa
gttgtgatcgtgaggccccttcaacgaatttcttgtccaatacatctctg
agctgaaaaataagtccctttattcatgtgcaccacctgccactcattca
ttttagatcctaatcctgtatttctctctctctctcactaatcgtcccgt
catatctgacccactataatgaggggaccaccactttgccccagatttcg
taatgagccaacatacactaggccctgttctagcacccccattgtgcatg
ggagacacatcgtctgttggttcgggtcagctgagatgacgtggcagatg
acgtcatgtttgttctctagcagatccctatcgtaaaataccgttctttg
ttcgtttatgagcacttcttgggaaacaagaagaatattagagaatattg
gattttaggaaatttcttgaccctaataatatgtatctcatggggctaat
tacgaaagatttagagctcactaaagcagatgtggataagctggaactat
agtcaattctcacgagatattattattagcttactcgttgaatttgatgc
cgtgttaggtagaagccgagaacacgatgaaccttggaagttatgtagtc
gagttttctggaagaaaaagtatatatagtttgataaaaagttacgtcat
aagttattggtcccgagtgtgtacactagaaacttgcgcaatcagttggt
caggtggtctaggacctttacatgtaatataattcattggtttgttgctc
tagatctcaaagaatatggttttcctgctgagaaacaaaatttttttttc
aaatgttcgcgatattatacgatttttttgcgctgaaaaatacggtatcc
ggactcgacacgacagtttttcaataaattcggaaaggtacatatgcgcc
tttgaagagtactgtaattttaaacatttgttgatgcagtaaatattctc
acggatttttagaggtttttttttgaatatttatacagttatattagagt
taaaaaaataaatctatttttatcgaaatttatgaaaaatctactcccca
gaaacaaagtttgaatttacttaaaatgtatgtgcgcctttttaaattca
acaaaaatttatcaaattttgtctttttaatcacttttacttttttttcg
aaaaaaaaaaaaactttaaaaacaccgaaaattaaaatttttaattaccg
taatcctttaaaggcgcacacctctttttcgcaatcataaaaatttacag
gcacagaatttcctactgtaacgtgttttctcgatagaaacgtttctcca
aatcgaaatttttattagcaatcatcaattcgtcatgtttctgtgctgga
gcacattgttatgcagtgctcatgaatattcacagttgaaaatcgaattt
ttttttcttatttttattaacttctctcctcactcaagtgcaatctcatt
tcggcggaacgatgaaagcggactcgtttgaaacggattacactgctggc
tggctccatcttttttatttctggtttttttcccgacacgggaggtcatc
cgtccacgtcttcaatcttattcgcttctccttctatctatctctcttcc
aaaaaaatggaacagattgtccgccttctactttccgcatgcgcctattc
tagacatcgagaagaagcgagagaatccgaaaaactccgccgtccggcgc
ctagcgttcatcccgtcgcatccaatttccttcacccctgtctccagtct
ctaatctgtgtttcccagaccttctccttcttcttctcccctctttcttc
cctttcttttctacgattcctagacctgcccggttgaccatcgggcccac
catttatcgagcgcgtccgtctgttcgttgctgtgagcgcgcgcgcgcga
gcgcacactgcacaccatttgaccgcaacgagccgagagagtgtgtgaaa
tgaagagacgccgagtggacacgttgctctacaccaaacgcgctacacca
aatgggcggagacccaatggtgcaccaagtcagcagtataaaaggaatgg
aaatggtccattcagtcatcagttgtttttttattttctcttttctccca
tcactttctcccttcttcccctctcctaatttccattcccaactattatt
ctcggatcagatcgagccattgctggtttcttccacagtggtactttcca
ttagaactatcaccgggtggaaactagcagtggctcgatcttttccactt
gctccaccgctgtcggggaaccgcgccaattttcgcttcagtgctagacc
atccaaagtgtctatcaccgggtgaaaattcgcatgggtccccgacgcgg
aaagataaaatatcttaaaatcgattctagaaacccttggaccagtgtgg
gtgtccgttgcggtgctacattctctaatctgtatcaccgggtgaacact
tgcagtggtcctcgtggtttctctgtgagccaggtcctgttccggttttt
tccgtggtgataacgcatccaaaagtctctatcaccgggagaaaaactgg
agtaggacctgtgactcattccgatttctggagttttcccctacattcta
ccattcagctactgattattgaattcctgatataccgagagcccagctga
tttcgtcttggtaataagctcgtcattgagattatcaccgggtgtaaatc
agcttggctctggtgtctccgaacctcctgtccgcacctcagtggatgta
tgccatgatgataagatatcagaaatcctatcaccgggtgtacatcagct
aaggtgcgggtacaggtgcatttgatatcaaggtgagttatttttaagtg
ggtcccagagaccttggtggtttttctctgcagtgatagatacttctaac
aactcgctatcaccgggtgaaaaatcacctaggtctggagcctcctgctc
tttttttgctgtttttaaacttaaacttaaaactaacactttatcaaaat
aaagtcttccaaaatcttttttctgatctgccggaagactttccatgaat
ttgtccaaaactcgttgcactttatcctcgtcgtaatcatttgacaccat
atctttggataactagaataattgaacattggtttaaaaaaattctctca
aaaaaaaaatcacaaacctgatgaattttagcctcatctatagcagtatc
tgcgagaagaatcgtaagattcattgataattctatatattttccaataa
ttttatccgaagctggatgtgaagtttctacagtacctccgtggcataat
actacaatggaagcaaaaagagcgacaattaggatcgtcattttagtgga
gaatgatgaattgacccggctctttgggggttggaggattcattttcccc
ttcaacaggtgctcaaataattaaagagaatagaaccgacgatatatggg
tcaaatgtttatacagttgtgctactaaacgtattgttacacgcgttatt
aataattagaattagaattatatcgttttgtacggattgagaatcccatt
tgggtcgaaaatgttcttgagcttctttgtcaaaagtcgttcttcaggat
cttttccgaatgtggagtacggtagcttcagttgaccgattccatgttca
gctgaaattgacccgccgtgatcgacaacccattcgtagaggaagggata
gagcctggaatttgaaattattaatagaattaaaattttataaaaaagaa
aaatctcgaaacttacaatttttcaagttcttcattgtgtttttcagatg
taatatttaaatgagtgtttccatctcccaaatgtccataagtgacaatt
cttttagccaaagaaccacatcgttccttcatcacattcgtcaattcata
ataattttccaatggtaaagaaacatcatgcttatagacatatccatctc
tggtaaccgccaatggtgcactttctctcaattgccacatcttcgtagct
tctgcagaagatccagcgagcactccgtcgataatcagattttttgagag
gcattcatccaaaaatgcgctcattttctccatatcgtgatcttcattgg
atcctgatgtttcgacaaggatcgagaatggggttggagcattcagtact
gggtgcaatcctagattcgttttcaaacattccatcgtagcatcgtcgag
aagttcgaaggaggaaaggatttcagtgaggctggattttgcaagcttca
gtacttcgcagcattttttgaaggattcgatgcctgaaaaaaattagaaa
ttgaaaaatttgaacccattatataaatattcaacctaccaagcatcgca
ctttgtacacttttcggtttaggaaccgcagtcattgtgacgcttgtgat
aacacccaactgcccttcacttcccaagaataggtgtggagtgtgcaaag
ttgtgttgtccttccgaatgcttgatcccaaatgtagaacagttccatgt
tcatcgggaagaaccaccgtgagcccgagaagatgtgcgtgaagacttcc
gtatcgaatcaaccgaatccctcctgcacacgtggcaatatttcctccaa
tctgacaggatcctttggctccgagatcaaaaggcatcatatatccgagt
tttgcaagtttgttgtccaagtcttccagaataaaaccagaatcacactt
gagaattcccattgtgtcgtcgaaagagaattgcttgttgattttattca
ttgatataacaacttcatcatgtactggaattgatccaccaacgagtcct
gtattccctccttgtgggactactgccaatttgttcttggagcaatacgc
caatattgcagaaacctcttcggtgctcttcgggtagaggacgacactgc
caggacctggaaattaaaacatttaatatttaaagtacctatttaatatt
aaataaacctaatcttaaaatacaaatacctttaaattggcctgtccaat
ctgtagtatgatttgtaatatcgtccttcttcactgcatcttgcccgaga
aaattctcaaatgccattaaatccgactgcatcacttttgcaaatccttc
atgtctggcggcaagaactgctgcgtagcttctagttggtcttctgattc
gtggcaagattttcagaaacatctgaattcagaaacttttcaaaaaataa
cttgaaacttcaaaagaaatagtaggagacaaagctcggctaggtgaccg

>chrIII:2172325-2172669
CAGGCAGTCAGTCAGTCTCTCTCCACTCACATTCAGTCAGTCAGTGACCA
TCACCAGGTTGTGTGTGAGCCCCTTCCATTATTCTTCTGAACCCCCCTCC
CAACGCGGGAAGACTCGCCGGCAATGACACTGGTTATCTTTTCCATCGTG
GAATGCCCCCCATTGATTTTTTCCCCTTTTCGGGGGGAAAAAATTGGAAA
CGAGAAAGGTATCGGGTGTCATAGCCGGCGTGATCATCTTCCTCAAGTAT
TCCTCTGCTGATTTCGATATTCGGAGGAGCTCGGAGGCTGTTCAGCTGTA
AAATTGGTTGATTAAGCTCAAAAATCGGCGTTAACGCGGCTTTCC