Mercurial > repos > iuc > exonerate
comparison test-data/out.txt @ 0:f48ed38dfddf draft
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/exonerate commit e02d20338ee01ed58265d93e9cc5b0695a322d47
author | iuc |
---|---|
date | Thu, 02 Aug 2018 09:11:30 -0400 |
parents | |
children |
comparison
equal
deleted
inserted
replaced
-1:000000000000 | 0:f48ed38dfddf |
---|---|
1 | |
2 C4 Alignment: | |
3 ------------ | |
4 Query: sample | |
5 Target: sample | |
6 Model: ungapped:dna2dna | |
7 Raw score: 17680 | |
8 Query range: 0 -> 3536 | |
9 Target range: 0 -> 3536 | |
10 | |
11 1 : TGCATCGGTTATTTGCATTGGCTGGCATTTAATTTATGCACAAACACACACGCTGGAACACA : 62 | |
12 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
13 1 : TGCATCGGTTATTTGCATTGGCTGGCATTTAATTTATGCACAAACACACACGCTGGAACACA : 62 | |
14 | |
15 63 : TTAGTCATACGCAACGTTGCACAAATATTTATTAGCTATTGCAAGTCAGTGCGGGGCAAATA : 124 | |
16 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
17 63 : TTAGTCATACGCAACGTTGCACAAATATTTATTAGCTATTGCAAGTCAGTGCGGGGCAAATA : 124 | |
18 | |
19 125 : GCACCGTGAAATGCAAACGAAAGCATTGAGTGTGCTGGCATCATCGATTTAGCAGCCATAAA : 186 | |
20 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
21 125 : GCACCGTGAAATGCAAACGAAAGCATTGAGTGTGCTGGCATCATCGATTTAGCAGCCATAAA : 186 | |
22 | |
23 187 : TACTGCTCAACACTAAATCAATCATACGCAATGTGGTGCTAATTGATTGAGCAAACATTGCC : 248 | |
24 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
25 187 : TACTGCTCAACACTAAATCAATCATACGCAATGTGGTGCTAATTGATTGAGCAAACATTGCC : 248 | |
26 | |
27 249 : AAGATGCAATTGCCATGATCAAGGGGCGAAGGTTTCTTTGGGCCAAACAGAAGAGTGGTTTC : 310 | |
28 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
29 249 : AAGATGCAATTGCCATGATCAAGGGGCGAAGGTTTCTTTGGGCCAAACAGAAGAGTGGTTTC : 310 | |
30 | |
31 311 : GCCACTTAACTAGAGGTTAATTATTAGATTGTATTAGCCAGCTAGCTGCGTACGAGCATATT : 372 | |
32 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
33 311 : GCCACTTAACTAGAGGTTAATTATTAGATTGTATTAGCCAGCTAGCTGCGTACGAGCATATT : 372 | |
34 | |
35 373 : GAGCTACTAATGATACCACAAGTTCGCAGTTATCGCCCCAGTGGAACCCTTGAGCTTAATCC : 434 | |
36 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
37 373 : GAGCTACTAATGATACCACAAGTTCGCAGTTATCGCCCCAGTGGAACCCTTGAGCTTAATCC : 434 | |
38 | |
39 435 : CAGTGCCCCATTAAATACTTAAGCGCGGACCCTCCAGCGCTACTCCACTCGAGCGGTTCAAC : 496 | |
40 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
41 435 : CAGTGCCCCATTAAATACTTAAGCGCGGACCCTCCAGCGCTACTCCACTCGAGCGGTTCAAC : 496 | |
42 | |
43 497 : GAACTGGCCAGCACTCGAAACTAAAGCCCTACCATGATTCAATATCAAGTTGGCAACTCGAA : 558 | |
44 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
45 497 : GAACTGGCCAGCACTCGAAACTAAAGCCCTACCATGATTCAATATCAAGTTGGCAACTCGAA : 558 | |
46 | |
47 559 : ACCCACTTGGCATTAAGTATGACTGACCTGCAGGCGACTCAACCTCAACCTGAAGCTCAACC : 620 | |
48 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
49 559 : ACCCACTTGGCATTAAGTATGACTGACCTGCAGGCGACTCAACCTCAACCTGAAGCTCAACC : 620 | |
50 | |
51 621 : TGAAGCTCAACCGGCGCATTCAGCTCCAGCGTTTTGCATTTAGCATTCAGCCGTGTCCAATG : 682 | |
52 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
53 621 : TGAAGCTCAACCGGCGCATTCAGCTCCAGCGTTTTGCATTTAGCATTCAGCCGTGTCCAATG : 682 | |
54 | |
55 683 : CTAAGATCAATGCCACTCCACGCTGGCTGTGCCAACTTCCTGTTGCAGCAACCACTACTACC : 744 | |
56 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
57 683 : CTAAGATCAATGCCACTCCACGCTGGCTGTGCCAACTTCCTGTTGCAGCAACCACTACTACC : 744 | |
58 | |
59 745 : CTATATGGACACAATGTGCCACGCCACGAGTATAGTGTATCGTACCTACACGAGTATCTGGC : 806 | |
60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
61 745 : CTATATGGACACAATGTGCCACGCCACGAGTATAGTGTATCGTACCTACACGAGTATCTGGC : 806 | |
62 | |
63 807 : CAGTCCGCAGTCCTAGTTCTTCCCTGCTCCTTTTTATTTAAACACTTCCTCATTTCGCTTTG : 868 | |
64 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
65 807 : CAGTCCGCAGTCCTAGTTCTTCCCTGCTCCTTTTTATTTAAACACTTCCTCATTTCGCTTTG : 868 | |
66 | |
67 869 : TGCCCTGGCATTTGGCAGCTATTCTGTGTCAATTCCCGGTGAGTGTCATTCGAACTGGTGAA : 930 | |
68 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
69 869 : TGCCCTGGCATTTGGCAGCTATTCTGTGTCAATTCCCGGTGAGTGTCATTCGAACTGGTGAA : 930 | |
70 | |
71 931 : CCGGAGAATGGAGCAGTCGCCAGCCGAGGATTCAGAGCCAGAACCCCAAACCCAGAACCCAG : 992 | |
72 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
73 931 : CCGGAGAATGGAGCAGTCGCCAGCCGAGGATTCAGAGCCAGAACCCCAAACCCAGAACCCAG : 992 | |
74 | |
75 993 : AAGGCCAGGTGAATGGGATCGGGATTCACCCAGTCCTCGCTCGCCTGGCTGAGTGCCAAGTG : 1054 | |
76 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
77 993 : AAGGCCAGGTGAATGGGATCGGGATTCACCCAGTCCTCGCTCGCCTGGCTGAGTGCCAAGTG : 1054 | |
78 | |
79 1055 : TAGTGCAATAAACTTGCCGTCCTGAATGGCTGGCAATCAAAGATCTGAATGCAAGATACGAT : 1116 | |
80 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
81 1055 : TAGTGCAATAAACTTGCCGTCCTGAATGGCTGGCAATCAAAGATCTGAATGCAAGATACGAT : 1116 | |
82 | |
83 1117 : GACATTTACTCGCACATTCAATTGCGCTTTTGATTTGAATATTTACATGCTTTCTGGTCGTA : 1178 | |
84 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
85 1117 : GACATTTACTCGCACATTCAATTGCGCTTTTGATTTGAATATTTACATGCTTTCTGGTCGTA : 1178 | |
86 | |
87 1179 : GTCCCAGTTCCGCAGACTCGAGTCCCTCGGGCTGCCATTCTTTCATGTCCTTTCGTTCTATT : 1240 | |
88 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
89 1179 : GTCCCAGTTCCGCAGACTCGAGTCCCTCGGGCTGCCATTCTTTCATGTCCTTTCGTTCTATT : 1240 | |
90 | |
91 1241 : GACATAGTCAAATTGGCTTTGCTGCACAGCGAGAAAATGTACTTAACTTCCACACAATCCTG : 1302 | |
92 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
93 1241 : GACATAGTCAAATTGGCTTTGCTGCACAGCGAGAAAATGTACTTAACTTCCACACAATCCTG : 1302 | |
94 | |
95 1303 : GCTATTTGCTGCTATGACTGTAAGCATAATTTATTTTAGGGTAAATGGGTGAGTGACCAAAA : 1364 | |
96 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
97 1303 : GCTATTTGCTGCTATGACTGTAAGCATAATTTATTTTAGGGTAAATGGGTGAGTGACCAAAA : 1364 | |
98 | |
99 1365 : GGCATGCCGTGCAGTTCATTTTATCAAAGCACCATGACTAACTGGTACAACCATTTTTTCTG : 1426 | |
100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
101 1365 : GGCATGCCGTGCAGTTCATTTTATCAAAGCACCATGACTAACTGGTACAACCATTTTTTCTG : 1426 | |
102 | |
103 1427 : CGTGCCTTTCGGGTCAACCGAATCAGGCCCTAATTGATTTTCAAATGTTTCCACAGCGTCTT : 1488 | |
104 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
105 1427 : CGTGCCTTTCGGGTCAACCGAATCAGGCCCTAATTGATTTTCAAATGTTTCCACAGCGTCTT : 1488 | |
106 | |
107 1489 : AAAGTCCAGTCCTTATTTAAACAACTTACTAAGTATTGCAGAGCCTTGGCATACTTAGCTGC : 1550 | |
108 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
109 1489 : AAAGTCCAGTCCTTATTTAAACAACTTACTAAGTATTGCAGAGCCTTGGCATACTTAGCTGC : 1550 | |
110 | |
111 1551 : AGTTATGCATTTCAAGCATAAACAACTAATTTGACTAATTGATAAGCCATGCAAAGGCAAAG : 1612 | |
112 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
113 1551 : AGTTATGCATTTCAAGCATAAACAACTAATTTGACTAATTGATAAGCCATGCAAAGGCAAAG : 1612 | |
114 | |
115 1613 : GCATCTCGAGATGTCTTGAGTCGACTTCACTGCACTTCTGGCCGGCTTGTCTCGGCCTGGTT : 1674 | |
116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
117 1613 : GCATCTCGAGATGTCTTGAGTCGACTTCACTGCACTTCTGGCCGGCTTGTCTCGGCCTGGTT : 1674 | |
118 | |
119 1675 : GGTTGCGTTTCTGTATCTTTGGCTCCGGCTGTTTGCTTTGTCCATCAACATCTTTTGAGCGG : 1736 | |
120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
121 1675 : GGTTGCGTTTCTGTATCTTTGGCTCCGGCTGTTTGCTTTGTCCATCAACATCTTTTGAGCGG : 1736 | |
122 | |
123 1737 : AGGCACTCAGGCGCAAACTGTTGCACTTCAGACCAGTCTGGAGAGCAGTGTTCACTAGGATA : 1798 | |
124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
125 1737 : AGGCACTCAGGCGCAAACTGTTGCACTTCAGACCAGTCTGGAGAGCAGTGTTCACTAGGATA : 1798 | |
126 | |
127 1799 : CGAGTATATACATAGGCTCATGTGGAGCCGGGATCAAGCCACCCCAAACCCCAAACCCCATT : 1860 | |
128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
129 1799 : CGAGTATATACATAGGCTCATGTGGAGCCGGGATCAAGCCACCCCAAACCCCAAACCCCATT : 1860 | |
130 | |
131 1861 : AATTGCAATCAATTTCGCTGTCAACACACACTCCAAATAACTGCGGGATATTTATTTATGGG : 1922 | |
132 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
133 1861 : AATTGCAATCAATTTCGCTGTCAACACACACTCCAAATAACTGCGGGATATTTATTTATGGG : 1922 | |
134 | |
135 1923 : CTGCGCTTCCCTTCAGCAACCTTTTGCAACTGAATAATTGCCTTATGACACATTATCATTAT : 1984 | |
136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
137 1923 : CTGCGCTTCCCTTCAGCAACCTTTTGCAACTGAATAATTGCCTTATGACACATTATCATTAT : 1984 | |
138 | |
139 1985 : TATTAAGGCTGCCACGGGTCGGCAAAGTAATCATTACCTCCTGCCCATATCATCCTGCCCCT : 2046 | |
140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
141 1985 : TATTAAGGCTGCCACGGGTCGGCAAAGTAATCATTACCTCCTGCCCATATCATCCTGCCCCT : 2046 | |
142 | |
143 2047 : GGGCCATGAACCTGGGAATTAGGGAGTCAGCATTGCAGTGCCCACAGCTCCTCTATGCTCAT : 2108 | |
144 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
145 2047 : GGGCCATGAACCTGGGAATTAGGGAGTCAGCATTGCAGTGCCCACAGCTCCTCTATGCTCAT : 2108 | |
146 | |
147 2109 : AAATATATTTCCAGCTGGCAACATTATATAATTATTTTGCCATGGATTGCATTGAACTTAGT : 2170 | |
148 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
149 2109 : AAATATATTTCCAGCTGGCAACATTATATAATTATTTTGCCATGGATTGCATTGAACTTAGT : 2170 | |
150 | |
151 2171 : CCGAGTGCGTCGATGTTGCTCGTTTGCTGTTTGCTGTTTGCTATTTCTGTTTGCACTTCTTG : 2232 | |
152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
153 2171 : CCGAGTGCGTCGATGTTGCTCGTTTGCTGTTTGCTGTTTGCTATTTCTGTTTGCACTTCTTG : 2232 | |
154 | |
155 2233 : CCGCAGGCGCGCAACTCTTCATGTGGCTTCTTCTCGTTTTTAGGCCAGAATCCAGAAGGCAG : 2294 | |
156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
157 2233 : CCGCAGGCGCGCAACTCTTCATGTGGCTTCTTCTCGTTTTTAGGCCAGAATCCAGAAGGCAG : 2294 | |
158 | |
159 2295 : CGTTCAGAACCCAGAATCCAGAATCCATGTGATGCCTTTGCGTGAATTTCATTTTAAAGTGC : 2356 | |
160 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
161 2295 : CGTTCAGAACCCAGAATCCAGAATCCATGTGATGCCTTTGCGTGAATTTCATTTTAAAGTGC : 2356 | |
162 | |
163 2357 : AAATATTTGCGGCCTGGCCCGGCCAGTTGCTTAAATGGAAAACTGGGCGAGAAAAAAGAATG : 2418 | |
164 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
165 2357 : AAATATTTGCGGCCTGGCCCGGCCAGTTGCTTAAATGGAAAACTGGGCGAGAAAAAAGAATG : 2418 | |
166 | |
167 2419 : CACTGGTAGCTCACAAACAGCCCACACAGAAACCAGTAATGAAATTGTGCGGCACTCGTCAT : 2480 | |
168 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
169 2419 : CACTGGTAGCTCACAAACAGCCCACACAGAAACCAGTAATGAAATTGTGCGGCACTCGTCAT : 2480 | |
170 | |
171 2481 : TGCGGCACTGGCCTTACATATAAATTATATAAAATATATACACATTTGTTTGGCATTGACCG : 2542 | |
172 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
173 2481 : TGCGGCACTGGCCTTACATATAAATTATATAAAATATATACACATTTGTTTGGCATTGACCG : 2542 | |
174 | |
175 2543 : GCCTACAAAGGAACTGCAGCCAGGGATGCAGCATGGGTATGATTTCCCTATAGTCGTGGCAA : 2604 | |
176 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
177 2543 : GCCTACAAAGGAACTGCAGCCAGGGATGCAGCATGGGTATGATTTCCCTATAGTCGTGGCAA : 2604 | |
178 | |
179 2605 : ATACCTTTAACACGAGTAAGTACAAGTAATGCCCAACTGAGGGCCTTCAAGTAATATTAAGA : 2666 | |
180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
181 2605 : ATACCTTTAACACGAGTAAGTACAAGTAATGCCCAACTGAGGGCCTTCAAGTAATATTAAGA : 2666 | |
182 | |
183 2667 : GAAGATATTTTTAAACATCTATCTTTTTTAAGGACACACATTCTAACTTTATTTACGAGAGA : 2728 | |
184 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
185 2667 : GAAGATATTTTTAAACATCTATCTTTTTTAAGGACACACATTCTAACTTTATTTACGAGAGA : 2728 | |
186 | |
187 2729 : CACTGGCACCCTCATACAAAATTCTAGAAAGCTAGTCAGTAAACTAGAACTGCAGTTCTCCC : 2790 | |
188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
189 2729 : CACTGGCACCCTCATACAAAATTCTAGAAAGCTAGTCAGTAAACTAGAACTGCAGTTCTCCC : 2790 | |
190 | |
191 2791 : CTGCTTATGACAATAACAGCAATTTGTATTTAAATTTAGGAATGACCAGGGCTCTTCCGCTC : 2852 | |
192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
193 2791 : CTGCTTATGACAATAACAGCAATTTGTATTTAAATTTAGGAATGACCAGGGCTCTTCCGCTC : 2852 | |
194 | |
195 2853 : CACCCTGGCCAGTATAATTTGTGCATCTCTAGCCAATACAAACTTATTATATACTTGCAAAA : 2914 | |
196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
197 2853 : CACCCTGGCCAGTATAATTTGTGCATCTCTAGCCAATACAAACTTATTATATACTTGCAAAA : 2914 | |
198 | |
199 2915 : GTTGTGCACTGTAAATATTTGCGGCGACCACCCGCACTTTCGCCATGACTACAAAATGGGTG : 2976 | |
200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
201 2915 : GTTGTGCACTGTAAATATTTGCGGCGACCACCCGCACTTTCGCCATGACTACAAAATGGGTG : 2976 | |
202 | |
203 2977 : GCATGAAATGGGGGCTTTTGGGGGGCAACCGCAGAGAATGCTTGACTTTGGCCGGTAAAAAA : 3038 | |
204 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
205 2977 : GCATGAAATGGGGGCTTTTGGGGGGCAACCGCAGAGAATGCTTGACTTTGGCCGGTAAAAAA : 3038 | |
206 | |
207 3039 : CTACGCAGACCACCCACCACCCAACCCGGTTTTTCTCTCTTGGCCACGTTTATTGATGGCGG : 3100 | |
208 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
209 3039 : CTACGCAGACCACCCACCACCCAACCCGGTTTTTCTCTCTTGGCCACGTTTATTGATGGCGG : 3100 | |
210 | |
211 3101 : CGGGAAGTGCTTTAATGGAAATTTAAGTATCATCGTTTAAAATGAAGCAGAAAAGCGCAAGC : 3162 | |
212 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
213 3101 : CGGGAAGTGCTTTAATGGAAATTTAAGTATCATCGTTTAAAATGAAGCAGAAAAGCGCAAGC : 3162 | |
214 | |
215 3163 : GAACGAAAGACCCTGGAAAATTGCGAGTTGCGACTGGTATTGCGACCCTTGAGCTTTGGTCA : 3224 | |
216 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
217 3163 : GAACGAAAGACCCTGGAAAATTGCGAGTTGCGACTGGTATTGCGACCCTTGAGCTTTGGTCA : 3224 | |
218 | |
219 3225 : TTGCGTTGGCAACGCAAATTATTATTTTTATTATTATTGCAGGTTTTCGGTGCACATTTATT : 3286 | |
220 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
221 3225 : TTGCGTTGGCAACGCAAATTATTATTTTTATTATTATTGCAGGTTTTCGGTGCACATTTATT : 3286 | |
222 | |
223 3287 : TCATGCAACTTTACAGCGCTGCACATAGAAATTATGTACAGGCCGCGTGGGCCATAATGCAG : 3348 | |
224 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
225 3287 : TCATGCAACTTTACAGCGCTGCACATAGAAATTATGTACAGGCCGCGTGGGCCATAATGCAG : 3348 | |
226 | |
227 3349 : ATTGCCAACCCGAGAAGGGTAACTCGGAGTGAAATGGCGGGAATTAGGCAAGCAAACAGGCA : 3410 | |
228 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
229 3349 : ATTGCCAACCCGAGAAGGGTAACTCGGAGTGAAATGGCGGGAATTAGGCAAGCAAACAGGCA : 3410 | |
230 | |
231 3411 : ACTAAAATATGCAACGCAGGCAGTGGGGAAATTTGATGGGCGCCAGAAAAGGCCGTGAAAAG : 3472 | |
232 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
233 3411 : ACTAAAATATGCAACGCAGGCAGTGGGGAAATTTGATGGGCGCCAGAAAAGGCCGTGAAAAG : 3472 | |
234 | |
235 3473 : GCCGTAAAACTGGGCCAAGTAATGAGCTACGGCGGCCACACATTAAATATGCAACAATTAAA : 3534 | |
236 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
237 3473 : GCCGTAAAACTGGGCCAAGTAATGAGCTACGGCGGCCACACATTAAATATGCAACAATTAAA : 3534 | |
238 | |
239 3535 : AG : 3536 | |
240 || | |
241 3535 : AG : 3536 | |
242 | |
243 | |
244 C4 Alignment: | |
245 ------------ | |
246 Query: sample | |
247 Target: sample | |
248 Model: ungapped:dna2dna | |
249 Raw score: 108 | |
250 Query range: 607 -> 634 | |
251 Target range: 595 -> 622 | |
252 | |
253 608 : CTGAAGCTCAACCTGAAGCTCAACCGG : 634 | |
254 || || ||||||||||||||||||| | | |
255 596 : CTCAACCTCAACCTGAAGCTCAACCTG : 622 | |
256 | |
257 | |
258 C4 Alignment: | |
259 ------------ | |
260 Query: sample | |
261 Target: sample | |
262 Model: ungapped:dna2dna | |
263 Raw score: 108 | |
264 Query range: 595 -> 622 | |
265 Target range: 607 -> 634 | |
266 | |
267 596 : CTCAACCTCAACCTGAAGCTCAACCTG : 622 | |
268 || || ||||||||||||||||||| | | |
269 608 : CTGAAGCTCAACCTGAAGCTCAACCGG : 634 | |
270 | |
271 | |
272 C4 Alignment: | |
273 ------------ | |
274 Query: sample | |
275 Target: sample [revcomp] | |
276 Model: ungapped:dna2dna | |
277 Raw score: 102 | |
278 Query range: 2741 -> 2819 | |
279 Target range: 2819 -> 2741 | |
280 | |
281 2742 : ATACAAAATTCTAGAAAGCTAGTCAGTAAACTAGAACTGCAGTTCTCCCCTGCTTATGACAA : 2803 | |
282 ||||||| | || | | | || | |||||||||||||| | || | | | |
283 2819 : ATACAAATTGCTGTTATTGTCATAAGCAGGGGAGAACTGCAGTTCTAGTTTACTGACTAGCT : 2758 | |
284 | |
285 2804 : TAACAGCAATTTGTAT : 2819 | |
286 | || | ||||||| | |
287 2757 : TTCTAGAATTTTGTAT : 2742 | |
288 |